[Python知识库]python统计下列五行字符串中字符a、c、g、t出现的频数。

python统计下列五行字符串中字符a、c、g、t出现的频数。

数据集：

1.aggcacggaaaaacgggaataacggaggaggacttggcacggcattacacggagg
2.cggaggacaaacgggatggcggtattggaggtggcggactgttcgggga
3.gggacggatacggattctggccacggacggaaaggaggacacggcggacataca
4.atggataacggaaacaaaccagacaaacttcggtagaaatacagaagctta
5.cggctggcggacaacggactggcggattccaaaaacggaggaggcggacggaggc

将上面的数据集存入到data.txt文件中，源码如下：

import numpy as np
a=[]
with open('data.txt') as f:  #打开data.txt文档
    for (i, s) in enumerate(f):  # s就是每一行的数据
        #统计a、c、g、t的个数并将其存入a列表中
        a.append([s.count('a'), s.count('c'),
                  s.count('g'),s.count('t')])
b=np.array(a);  # 将数据转化为矩阵
print(b)

运行结果：

1、其中enumerate() 函数用于将一个可遍历的数据对象(如列表、元组或字符串)组合为一个索引序列，同时列出数据和数据下标，一般用在 for 循环当中。
2、count() 方法用于统计字符串里某个字符或子字符串出现的次数
3、append()函数是在列表a最后(末尾)添加我们统计的元素个数[a,c,g,t]，添加5个列表。