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[Python知识库]hd5文件的相关操作以及在python中的读写

一、介绍

  • Hierarchical Data Format Version 5, HDF5:?层次性数据格式第五版

    • 是一种存储相同类型数值的大数组的机制,适用于可被层次性组织且数据集需要被元数据标记的数据模型
    • 常用的接口模块为 h5py
  • HDF5 三大要素:

    • hdf5 files:?能够存储两类数据对象 dataset 和 group 的容器,其操作类似?python 标准的文件操作;File 实例对象本身就是一个组,以?/?为名,是遍历文件的入口
    • dataset(array-like):?可类比为?Numpy?数组,每个数据集都有一个名字(name)、形状(shape) 和类型(dtype),支持切片操作
    • group(folder-like):?可以类比为?字典,它是一种像文件夹一样的容器;group 中可以存放 dataset 或者其他的 group,键就是组成员的名称,值就是组成员对象本身(组或者数据集)

二、打开工具

直接用记事本打开hdf5文件的话,是一团乱码。HDFView是用来查看hdf5文件的软件,可以免费使用,好多人都有闪退的情况,这是因为没有添加环境变量。

HDF5 数据可视化工具 HDFView:

  • 支持全平台,可查看数据的细节
  • 注意:?打开路径中不要包含中文
  • 下载链接:HDFView官方网站下载
  • 选择自己需要的版本,点击Download
  • ?选择自己需要的版本,Win10系统64位选择下面这个版本,点击Download
  • 下载好压缩包后,解压,打开文件夹,点击exe文件开始安装
  • 然后一路next,选择安装路径,等待安装结束。
  • 添加环境变量:不添加环境变量就会闪退,所以这一步是必要的。
  • 找到bin的本地路径并添加进path变量
  • 然后一路确定即可

?三、查看HDF文件

1.点击exe可执行文件打开软件。

?

2.点击file->open打开HDF文件

3.然后就可以查看数据了。

四、Python中打开

# -*- coding: utf-8 -*-

import h5py
import numpy as np

#HDF5的写入:
imgData = np.zeros((2,4))
f = h5py.File('HDF5_FILE.h5','w')   #创建一个h5文件,文件指针是f
f['data'] = imgData                 #将数据写入文件的主键data下面
f['labels'] = np.array([1,2,3,4,5])            #将数据写入文件的主键labels下面
f.close()                           #关闭文件

#HDF5的读取:
f = h5py.File('I://AMSR//AMSR_U2_L3_SeaIce12km_B04_20171230.he5','r')   #打开h5文件
# 可以查看所有的主键
motion = f['motion']
x = motion
print(x)
print()
for key in f.keys():
    print(f[key])

?

?

?

??

????????

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加:2022-04-04 12:06:36  更:2022-04-04 12:09:25 
 
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