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[Python知识库]散文:dflow 是如何实现slice的

Slice 是 dflow 的核心功能之一,但仅限于 PythonOP
如果将一些小的 PythonOP 填到一个 steps 模板里,这些小 OP 就可以共同实现一些复杂的功能,但可惜的是,steps 不支持 slice 这一功能

为了钻这个牛角尖,我决定看一下 PythonOP 的源码。看了一段时间,没有头绪,于是决定写下自己读代码的过程,梳理思路。所以这篇文章可能会比较乱,大家看一乐就好。

PythonOP, OP and Steps

首先复习一下dflow里的一些概念,OP 是最基本的单元,PythonOP是OP的包装,一堆PythonOP线性排列或者循环组合可以组成Steps
在这里插入图片描述

在这里插入图片描述
下面我们来看一个简单的PythonOP


class Duplicate(OP):
    def __init__(self):
        pass

    @classmethod
    def get_input_sign(cls):
        return OPIOSign({
            'msg': str,
            'num': int,
            'foo': Artifact(Path),
            'idir': Artifact(Path),
        })

    @classmethod
    def get_output_sign(cls):
        return OPIOSign({
            'msg': str,
            'bar': Artifact(Path),
            'odir': Artifact(Path),
        })

    @OP.exec_sign_check
    def execute(
            self,
            op_in: OPIO,
    ) -> OPIO:
        op_out = OPIO({
            "msg": op_in["msg"] * op_in["num"],
            "bar": Path("output.txt"),
            "odir": Path("todir"),
        })

        content = open(op_in['foo'], "r").read()
        open("output.txt", "w").write(content * op_in["num"])

        Path(op_out['odir']).mkdir()
        for ii in ['f1', 'f2']:
            (op_out['odir']/ii).write_text(op_in['num']
                                           * (op_in['idir']/ii).read_text())

        return op_out

这是一个简单的OP模板,他直接继承了OP,实现了类似下面的Python函数:

def aaa(in_msg: str, in_artifact: Artifact):
	op_in = {"in_msg": in_msg, "in_artifact": in_artifact}
	op_out = execute(op_in)
	out_msg, out_artifact = op_out["out_msg"], op_out["out_artifact"]
	return out_msg, out_artifact

注意到,我们这里尚未涉及PythonOP,但已经默认,这是一个PythonOP了,准确的说,这时候的duplicate还只是一个继承了OP的一个类,还不能直接使用,我们需要套一个壳才能使用:

    step = Step(
        name="step",
        template=PythonOPTemplate(Duplicate, image="python:3.8"),
        parameters={"msg": "Hello", "num": 3},
        artifacts={"foo": artifact0, "idir": artifact1},
    )

因此duplicate严格来说,还只是一个半成品,它继承了OP,但又不是OP,需要套一个壳转化一下才能再次变成OP
我们点进PythonOPTemplate的定义,里面写着:
在这里插入图片描述


花开两朵,各表一枝。


前面小结一下:
我们平时写PythonOP都是按照固定的格式

def aaa(in_msg: str, in_artifact: Artifact):
	op_in = {"in_msg": in_msg, "in_artifact": in_artifact}
	op_out = execute(op_in)
	out_msg, out_artifact = op_out["out_msg"], op_out["out_artifact"]
	return out_msg, out_artifact

写一个半成品,套上PythonOP后转化成了真正的OP
那有没有方法绕过八股文格式,直接写“真正的OP”呢?
注意到,big steps那一节有过类似的应用,只不过当时的重点在于,对小OP串联组成大OP。但如果细心观察可以发现,这个大OP的输入输出和平时的PythonOP不一样。

因为这是一个原生的OP

具体来说,他做了如下的变化:

  1. 输入输出全局声明:
    steps = Steps(name="hello-steps")
    steps.inputs.parameters["foo"] = InputParameter()
    steps.outputs.parameters["foo"] = OutputParameter()
  1. 整个steps的输入分给各个小OP
    step1 = Step(
        name="step1",
        template=PythonOPTemplate(Duplicate, image="python:3.8"),
        parameters={"foo": steps.inputs.parameters["foo"]},
        key="step1"
    )
    steps.add(step1)
  1. 全局的输出源自小OP的输出
    step2 = Step(
        name="step2",
        template=PythonOPTemplate(Duplicate, image="python:3.8"),
        parameters={"foo": step1.outputs.parameters["foo"]},
        key="step2"
    )
    steps.add(step2)

    steps.outputs.parameters["foo"].value_from_parameter = \
        step2.outputs.parameters["foo"]
  1. 使用过程中无需PythonOP转换
    big_step = Step(name="big-step", template=steps,
                    parameters={"foo": Hello("hello")})

我们可以得出如下结论:
Steps直接集成了OP,虽然看起来是一群小PythonOP的组合,但不是PythonOP
他的逻辑更直接:拿到输入直接,do something,然后输出

def execute(in_msg: str, in_artifact: Artifact):
	# do something
	return out_msg, out_artifact

对比一下之前的PythonOP

def aaa(in_msg: str, in_artifact: Artifact):
	op_in = {"in_msg": in_msg, "in_artifact": in_artifact}
	op_out = execute(op_in)
	out_msg, out_artifact = op_out["out_msg"], op_out["out_artifact"]
	return out_msg, out_artifact

由此可见,PythonOP虽然更复杂,但写起来按照八股文,还是很轻松的,只需要关注execute逻辑,做好变量检查即可。相比之下,steps需要一个个声明输入输出变量类型(很长),使用的时候也是很长一串。
小结一下:
PythonOP和steps都是OP,只不过实现的方式不同,最终在容器里,二者都是要转化成普通OP的格式的。
具体来说,PythonOP把输入输出变量转换成普通OP的输入输出变量,放入执行逻辑里就可以了。而steps则是等到一个个的PythonOP转换成普通的OP,再给套上整个流的输入输出即可,最终也是变成了OP。

所以,虽然steps是PythonOP的组合,但steps并不是一种PythonOP,而是一种将各OP串起来的大OP

PythonOP 是怎么转化成 OP 的

此时,我们大概已经知道答案了。PythonOP把半成品的输入输出解包变成了OP。
干的事情是这样的,但具体是如何实现的呢?
我写了简单的程序:

import time
from pathlib import Path

from dflow import Step, Workflow, download_artifact, upload_artifact
from dflow.python import (OP, OPIO, Artifact, OPIOSign, PythonOPTemplate,
                          upload_packages)


class Duplicate(OP):
    def __init__(self):
        pass

    @classmethod
    def get_input_sign(cls):
        return OPIOSign({
            'msg': str,
            'num': int,
            'foo': Artifact(Path),
            'idir': Artifact(Path),
        })

    @classmethod
    def get_output_sign(cls):
        return OPIOSign({
            'msg': str,
            'bar': Artifact(Path),
            'odir': Artifact(Path),
        })

    @OP.exec_sign_check
    def execute(
            self,
            op_in: OPIO,
    ) -> OPIO:
        op_out = OPIO({
            "msg": op_in["msg"] * op_in["num"],
            "bar": Path("output.txt"),
            "odir": Path("todir"),
        })

        content = open(op_in['foo'], "r").read()
        open("output.txt", "w").write(content * op_in["num"])

        Path(op_out['odir']).mkdir()
        for ii in ['f1', 'f2']:
            (op_out['odir']/ii).write_text(op_in['num']
                                           * (op_in['idir']/ii).read_text())

        return op_out

a_OP = PythonOPTemplate(op_class=Duplicate, image='python:3.8')

下面我用最笨的方法,打断点进去看看:
进来以后第一块是确认了一下op变量类型,然后把输入输出解包

        op = None
        if isinstance(op_class, OP):
            op = op_class
            op_class = op.__class__
        class_name = op_class.__name__
        input_sign = op_class.get_input_sign()
        output_sign = op_class.get_output_sign()

在这里插入图片描述
后面涉及 input_sign 就是直接当 dict 使用了
解包完,进行了一些附属功能的检查
在这里插入图片描述
这里我们暂时用不到
后面就是upload一些包,对传进来的变量进行redistribution,看起来很长,主要是因为要检查的类型比较多,架构还是很清晰的
最后通过 render_script 把收进来的变量写成普通的OP脚本

PythonOP是如何实现slice的

上一节的核心结论就是,PythonOP 通过繁琐的变量检查对输入输出变量进行了解包,并将其转化为了普通OP
也就是:

def aaa(in_msg: str, in_artifact: Artifact):
	op_in = {"in_msg": in_msg, "in_artifact": in_artifact}
	op_out = execute(op_in)
	out_msg, out_artifact = op_out["out_msg"], op_out["out_artifact"]
	return out_msg, out_artifact

解包,变成了

def execute(in_msg: str, in_artifact: Artifact):
	# do something
	return out_msg, out_artifact

slice 就是在此基础上添加的一些辅助功能。
dflow的文档里介绍slice时提到,他是通过调用step的with param实现的
step的with param最基础的用法如下:

step = Step(
    ...
    parameters={"msg": "{{item}}"},
    with_param=steps.inputs.parameters["msg_list"]
)

step运行时,会从 ["msg_list"] 抽出 msg 赋给 "{{item}}" ,成为 steps 这个 OP 中一个切片过了的变量。
我们需要谨记,PythonOP也是一个普通的OP,因此他实现并行,底层原理也只是调用了这一个可切片的点

那一个可切片的变量,如何影响一群变量的呢?

我们以 input_parameter 为例,其余均差不多
下面是 input_parameter 在 slice 里的部分
在这里插入图片描述
回顾一下 slice 的用法:

    hello = Step("hello",
                 PythonOPTemplate(Hello, image="python:3.8",
                                  slices=Slices("{{item}}",
                                                input_parameter=["filename"],
                                                output_artifact=["foo"]
                                                )
                                  ),
                 parameters={"filename": ["f1.txt", "f2.txt"]},
                 with_param=argo_range(2))

我们对照 slices 部分

                                  slices=Slices("{{item}}",
                                                input_parameter=["filename"],
                                                output_artifact=["foo"]
                                                )

第一项 "{{item}}" 赋值给了 slices
input_parameter=["filename"] ,进一步赋值给了 self.input_parameter
self.input_parameter 在 template 里就变成了 slices.input_parameter
注意到,初始化的 slices.input_parameter = ["filename"]
我们来看下面做了什么:

            if slices.input_parameter:
                input_parameter_slices = {
                    name: slices.slices for name in slices.input_parameter}

input_parameter_slices 变成了一个 dict, key 是 列表里的每一个元素,value 是 slices.slices 也就是 "{{item}}"
这一步之后,有了下面的一个变量:

input_parameter_slices = {"filename": "{{item}}"}

下面这个变量被传入了 render_script 函数
在这里插入图片描述
再往后就是这句话了:

for name, sign in input_sign.items():
    slices = self.get_slices(input_parameter_slices, name)

检查传入的变量,然后以查表的方式得到 slices

    def get_slices(self, slices_dict, name):
        slices = None
        if slices_dict is not None:
            slices = self.render_slices(slices_dict.get(name, None))
        return slices

get_slices 接收的是一个 dict 和一个 name
我们注意到,dict 就是 {"filename": "{{item}}"} ,它可以有很多项,这里只涉及了一项
查表就是

for name, sign in input_sign.items():

要遍历每一个输入的 name 嘛
如果这个 name 被 slice 了,查表结果就是 "{{item}}" ,如果没有,就是 None
对于本例,查找到的结果是 "{{item}}"
下面是如何操作这个 "{{item}}" 呢?

    def render_slices(self, slices=None):
        if slices is None:
            return None

        i = slices.find("{{item")
        while i >= 0:
            j = slices.find("}}", i+2)
            var = slices[i:j+2]
            if var not in self.dflow_vars:
                var_name = "dflow_var_%s" % len(self.dflow_vars)
                self.inputs.parameters[var_name] = InputParameter(value=var)
                self.dflow_vars[var] = var_name
            else:
                var_name = self.dflow_vars[var]
            slices = slices.replace(var, "{{inputs.parameters.%s}}" % var_name)
            i = slices.find("{{item")
        return slices

i = 0,后进入 while 循环,j=6
var = "{{item}}"

slices = slices.replace(var, "{{inputs.parameters.%s}}" % var_name)

随后把 slices 中的 "{{item}}" 替换成了 "{{inputs.parameters.%s}}" % var_name
while 循环的意思就是支持多处替换
dflow_vars 是什么呢?

            if var not in self.dflow_vars:
                var_name = "dflow_var_%s" % len(self.dflow_vars)
                self.inputs.parameters[var_name] = InputParameter(value=var)
                self.dflow_vars[var] = var_name
            else:
                var_name = self.dflow_vars[var]

往上看,发现他初始化是一个空的 dict

var_name = "dflow_var_%s" % len(self.dflow_vars)

“var_name = dflow_var_0”

slices = slices.replace(var, "{{inputs.parameters.%s}}" % var_name)

返回值就变成了 "{{inputs.parameters.dflow_var_0}}"

我们回到 374 行

slices = self.get_slices(input_parameter_slices, name)

查表结果是:

slices = "{{inputs.parameters.dflow_var_0}}"

第二次查表,由于上一次查表后已经给 self.dflow_vars 填充了一个 dict ,所以第二次查表所得值为:

slices = "{{inputs.parameters.dflow_var_1}}"

这个str是怎么用的呢?

                    script += "input['%s'] = handle_input_parameter('%s', "\
                        "r'''{{inputs.parameters.%s}}''', input_sign['%s'], "\
                        "%s, '/tmp')\n" % (name, name, name, name, slices)

这段话用到了 handle_input_parameter,是这样定义的:

def handle_input_parameter(name, value, sign, slices=None, data_root="/tmp"):
    if "dflow_list_item" in value:
        dflow_list = []
        for item in jsonpickle.loads(value):
            dflow_list += jsonpickle.loads(item)
        obj = convert_dflow_list(dflow_list)
    elif isinstance(sign, BigParameter):
        with open(data_root + "/inputs/parameters/" + name, "r") as f:
            content = jsonpickle.loads(f.read())
            if sign.type == str:
                obj = content["value"]
            else:
                obj = jsonpickle.loads(content["value"])
    else:
        if isinstance(sign, Parameter):
            sign = sign.type
        if sign == str and slices is None:
            obj = value
        else:
            obj = jsonpickle.loads(value)

    if slices is not None:
        assert isinstance(
            obj, list), "Only parameters of type list can be sliced, while %s"\
            " is not list" % obj
        if isinstance(slices, list):
            obj = [obj[i] for i in slices]
        else:
            obj = obj[slices]

    return obj

这段话就是把变量按照切片切好再返回。
一堆细节,就先这样吧,有空再补

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加:2022-08-19 19:00:11  更:2022-08-19 19:01:58 
 
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