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[Python知识库]Python Seaborn 热力图绘制

seaborn.heatmap()热力图,常用于展示一组变量的相关系数矩阵,列联表的数据分布,通过热力图可以直观地看到所给数值大小的差异状况和不同特征之间的关联性。

seaborn.heatmap(data, vmin=None, vmax=None, cmap=None, center=None, robust=False, annot=None, fmt='.2g', annot_kws=None, linewidths=0, linecolor='white', cbar=True, cbar_kws=None, cbar_ax=None, square=False, xticklabels='auto', yticklabels='auto', mask=None, ax=None, **kwargs)

Parameters:
data: 矩形数据集,可以强制转换为ndarray格式数据的2维数据集。如果提供了Pandas DataFrame数据,索引/列信息将用于标记列和行。
vmin, vmax: 浮点型数据,可选参数。用于锚定色彩映射的值,否则它们是从数据和其他关键字参数推断出来的。
cmap: 颜色条名称或者对象,或者是颜色列表,可选参数。从数据值到颜色空间的映射。 如果没有提供,默认值将取决于是否设置了“center”。
center: 浮点数,可选参数。绘制有色数据时将色彩映射居中的值。 如果没有指定,则使用此参数将更改默认的cmap。
robust: 布尔值,可选参数。如果是True,并且vmin或vmax为空,则使用稳健分位数而不是极值来计算色彩映射范围。
annot: 布尔值或者矩形数据,可选参数。如果为True,则在每个热力图单元格中写入数据值。 如果数组的形状与data相同,则使用它来代替原始数据注释热力图。
fmt: 字符串,可选参数。添加注释时要使用的字符串格式代码。
annot_kws: 字典或者键值对,可选参数。当annot为True时,ax.text的关键字参数。
linewidths: 浮点数,可选参数。划分每个单元格的行的宽度。
linecolor: 颜色,可选参数。划分每个单元的线条的颜色。描述是否绘制颜色条。
cbar: 布尔值,可选参数。
cbar_kw: 字典或者键值对,可选参数。
cbar_ax: 可选参数。用于绘制颜色条的轴,否则从主轴获取。
square: 布尔值,可选参数。如果为True,则将坐标轴方向设置为“equal”,以使每个单元格为方形。
xticklabels, yticklabels: 如果为True,则将坐标轴方向设置为“equal”,以使每个单元格为方形。
mask: 布尔数组或者DataFrame数据,可选参数。如果为空值,数据将不会显示在mask为True的单元格中。 具有缺失值的单元格将自动被屏蔽。
ax: 可选参数。绘制图的坐标轴,否则使用当前活动的坐标轴。其他关键字参数。所有其他关键字参数都传递给ax.pcolormesh。
Return:
ax: 热力图的轴对象。

代码示例

import numpy as np; np.random.seed(0)
import seaborn as sns; sns.set()
uniform_data = np.random.rand(10, 12)
ax = sns.heatmap(uniform_data)

其中,很多SCI论文中涉及到热力图的配色,主要是 cmap 参数控制,具体的参数范围如下:

cmaps =['YlOrBr_r', 'Accent', 'Accent_r', 'Blues', 'Blues_r', 'BrBG', 'BrBG_r', 'BuGn', 'BuGn_r', 'BuPu', 'BuPu_r', 'CMRmap', 'CMRmap_r', 'Dark2', 'Dark2_r', 'GnBu', 'GnBu_r', 'Greens', 'Greens_r', 'Greys', 'Greys_r', 'OrRd', 'OrRd_r', 'Oranges', 'Oranges_r', 'PRGn', 'PRGn_r', 'Paired', 'Paired_r', 'Pastel1', 'Pastel1_r', 'Pastel2', 'Pastel2_r', 'PiYG', 'PiYG_r', 'PuBu', 'PuBuGn', 'PuBuGn_r', 'PuBu_r', 'PuOr', 'PuOr_r', 'PuRd', 'PuRd_r', 'Purples', 'Purples_r', 'RdBu', 'RdBu_r', 'RdGy', 'RdGy_r', 'RdPu', 'RdPu_r', 'RdYlBu', 'RdYlBu_r', 'RdYlGn', 'RdYlGn_r', 'Reds', 'Reds_rnBu_r', 'YlGn_r', 'YlOrBr', 'YlOrRd', 'YlOrRd_r', 'afmhot', 'afmhot_r', 'autumn', 'autumn_r', 'binary', 'binary_r', 'bone', 'bone_r', 'brg', 'brg_r', 'bwr', 'bwr_r', 'cividis', 'cividis_r', 'cool', 'cool_r', 'coolwarm', 'coolwarm_r', 'copper', 'copper_r', 'crest', 'crest_r', 'cubehelix', 'cubehelix_r', 'flag', 'flag_r', 'flare', 'flare_r', 'gist_earth', 'gist_earth_r', 'gist_gray', 'gist_gray_r', 'gist_heat', 'gist_heat_r', 'gist_ncar', 'gist_ncar_r', 'gist_rainbow', 'gist_rainbow_r', 'gist_stern', 'gist_stern_r', 'gist_yarg', 'gist_yarg_r', 'gnuplot', 'gnuplot2', 'gnuplot2_r', 'gnuplot_r', 'gray', 'gray_r', 'hot', 'hot_r', 'hsv', 'hsv_r', 'icefire', 'icefire_r', 'inferno', 'inferno_r', 'jet', 'jet_r', 'magma', 'magma_r', 'mako', 'mako_r', 'nipy_spectral', 'nipy_spectral_r', 'ocean', 'ocean_r', 'pink', 'pink_r', 'plasma', 'plasma_r', 'prism', 'prism_r', 'rainbow', 'rainbow_r', 'rocket', 'rocket_r', 'seismic', 'seismic_r', 'spring', 'spring_r', 'summer', 'summer_r', 'tab10', 'tab10_r', 'tab20', 'tab20_r', 'tab20b', 'tab20b_r', 'tab20c', 'tab20c_r', 'terrain', 'terrain_r', 'twilight', 'twilight_r', 'twilight_shifted', 'twilight_shifted_r', 'viridis', 'viridis_r', 'vlag', 'vlag_r', 'winter', 'winter_r']

每个参数的配色如下所示:
在这里插入图片描述
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加:2022-10-31 11:52:04  更:2022-10-31 11:53:01 
 
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