大数据数据挖掘知识体系思维导图
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1 数据分析
1.1 基本理论
(1)拿到数据的第一件事,就是做数据分析。分析了解所有数据的分布和不合法数据的样式,为数据处理做准备。分析的内容主要包含以下几方面
1.2 MATLAB实现
待完善
1.3 Python实现
完整程序下载
import re
import numpy as np
import pandas as pd
import seaborn as sns
from pylab import rcParams
import matplotlib.pyplot as plt
import torch
%matplotlib inline
%config InlineBackend.figure_format='retina'
sns.set(style='whitegrid', palette='muted', font_scale=1.2)
HAPPY_COLORS_PALETTE = ["#01BEFE", "#FFDD00", "#FF7D00", "#FF006D", "#ADFF02", "#8F00FF"]
sns.set_palette(sns.color_palette(HAPPY_COLORS_PALETTE))
rcParams['figure.figsize'] = 25, 20
RANDOM_SEED = 42
np.random.seed(RANDOM_SEED)
torch.manual_seed(RANDOM_SEED)
train = pd.read_csv('data/train.csv', sep='\t')
train.info()
train.head(5)
train.isnull().sum()
print("train null nums")
print(train.shape[0]-train.count())
train['categories'].value_counts()
sns.countplot(train.categories)
plt.xlabel('categories count')
2 数据清洗
2.1 基本理论
数据清洗就是去除“脏”数据。可能包括以下问题
2.2 MATLAB实现
待完善
2.3 Python实现
(1)离散数据缺失值的处理-删除
train.dropna(axis=0, how='any', inplace=True)
(2)离散数据缺失值的处理-填充
当数据存在缺失值,用Pandas读取后均为NaN。用impute库的SimpleImputer类对这个数据集进行缺失值计算
from numpy import vstack,array,nan
from sklearn.impute import SimpleImputer
SimpleImputer().fit_transform(vstack(array([nan,nan,nan,nan]),train.values))
(3)时间序列缺失值的插值处理–线性插值
from scipy import interpolate
for indexs in train.columns:
if indexs =='time':
continue
train['rownum'] = np.arange(train.shape[0])
df_nona = train.dropna(subset = [indexs])
f = interpolate.interp1d(df_nona['rownum'], df_nona[indexs])
train[indexs] = f(train['rownum'])
train = train.drop(columns=['rownum'])
(4)时间序列缺失值的插值处理–K最邻近平均插值
k = 8
def knn_mean(ts, n):
out = np.copy(ts)
for i, val in enumerate(ts):
if np.isnan(val):
n_by_2 = np.ceil(n/2)
lower = np.max([0, int(i-n_by_2)])
upper = np.min([len(ts)+1, int(i+n_by_2)])
ts_near = np.concatenate([ts[lower:i], ts[i:upper]])
out[i] = np.nanmean(ts_near)
return out
train[indexs] = knn_mean(train[indexs].values,k)
3 特征工程
3.1 基本理论
特征工程是利用数据领域的相关知识来创建能够使机器学习算法达到最佳性能的特征的过程。 换句话说,特征工程就是一个把原始数据转变成特征的过程,这些特征可以很好的描述这些数据,并且利用它们建立的模型在未知数据上的表现性能达到更佳。俗话说“garbage in garbage out”。特征工程极大程度的决定了模型的输出效果。在整个模型的优化阶段,会来做特征工程来提升模型输出效果。
(1)特征的选择
一般表有很多列,并不是每一列都对于模型又增益。存在特征冗余。特征选择是最常用的特征降维手段,其比较简单粗暴,即映射函数直接将不重要的特征删除。由于数据分析以抓住主要影响因子为主,变量越少越有利于分析,如基因序列建模。特征选择目标有两种
- 特征是否发散:如果一个特征不发散,如方差接近于0,就说明这个特征基本没有差异,这个特征对于样本的区分没有任何作用。
- 特征与目标的相关性:与目标相关性高的特征应当优先选择。
特征选择的方法有过滤法、包装法、嵌入法
-
过滤法:按照发散性或者相关性对各个特征进行评分,通过设定阈值或待待选择值的个数来选择特征 -
包装法:根据目前函数(通过是预测效果评分)每次选择若干特征,或者排除若干特征 -
嵌入法:使用机器学习的某些算法那和模型进行训练,得到各个特征的权值,并根据系数从大到小进行选择特征。
(2)数据转换
主要针对一些长尾分布的特征,需要进行幂变换或者对数变换,使得模型(LR或者DNN)能更好的优化。需要注意的是,Random Forest 和 GBDT 等模型对单调的函数变换不敏感。其原因在于树模型在求解分裂点的时候,只考虑排序分位点。常见的数据转换有基于多项式的、指数函数的和对数函数的转换方法。
针对类别的离散特征,特征编码方式有如下,一般采用Onehot编码或者LabelEncoding 自然数编码
自然数编码、独热编码、哈希编码、统计编码、目标编码、嵌入编码、缺失值编码、多项式编码、布尔编码
针对数值特征可能涉及以下的变换
取整、分箱、放缩
(3)特征降维
多重线性分析的原则是特征组之间的相关系数较大,每个特征变量与其他特征变量之间的相关性高,故可能存在较大的共线性影响,这会导致模型估计不准确,因此后续,需要使用PCA对数据进行处理,去除多重共线性。
线性降维常用的方法又主成分分析法PCA ,线性判别分析法LDA。
- PCA:主要原理是通过某种线性投影,将高维的数据映射到低维的空间中表示,其期望在所投影的维度上数据的方差最大,以此达到较小的数据维度来保留较多的原数据点特性
- LDA:是一种有监督的线性降维算法,目标是使得降维后的数据尽可能容易被区分,其利用了标签的信息。
2.2 MATLAB实现
待完善
2.3 Python实现
(1)特征选择
from sklearn.feature_selection import VarianceThreshold
VarianceThreshold(threshold=3).fit_transform(train.values)
import numpy as np
from numpy import array
from sklearn.feature_selection import SelectKBest
from scipy.statx import pearsonr
SelectKBest(lambda X,Y:np.array(list(map(lambda x:pearsonr(x,X),X.T))).T[0],k=2).fit_transform(train.values,Target.values)
(2)数据转换
from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures
PolynomialFeatures().fit_transform(train.values)
from numpy import loglp
from sklean.preprocessing import FunctionTransformer
FunctionTransformer(loglp,validate=False).fit_transform(train.values)
(3)离散特征或目标变量编码
from numpy import array
from numpy import argmax
from sklearn.preprocessing import LabelEncoder
from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder
data = ['cold', 'cold', 'warm', 'cold', 'hot', 'hot', 'warm', 'cold', 'warm', 'hot']
values = array(data)
label_encoder = LabelEncoder()
integer_encoded = label_encoder.fit_transform(values)
print(integer_encoded)
onehot_encoder = OneHotEncoder(sparse=False)
integer_encoded = integer_encoded.reshape(len(integer_encoded), 1)
onehot_encoded = onehot_encoder.fit_transform(integer_encoded)
print(onehot_encoded)
(4)特征降维
from sklearn.decomposition import PCA
PCA(n_components =2).fit_transform(iris.data)
from sklearn.disctrminant_nanlysis import LinearDiscriminantAnalysis as LDA
LDA(n_components =2).fit_transform(iris.data,iris.target)
4 模型选择
4.1 基本理论
十大算法:https://zhuanlan.zhihu.com/p/25140821
-
分类
- 逻辑回归、决策树、C4.5,朴素贝叶斯,SVM,KNN,Adaboost,CART
-
聚类
-
关联规则
-
预测算法
4.2 MATLAB实现
4.3 Python实现
(1)决策树
from sklearn.datasets import load_wine
from sklearn import tree
from sklearn.model_selection import train_test_split
wine = load_wine()
Xtrain,Xtest,Ytrain,Ytest=train_test_split(wine.data,wine.target,test_size=0.3)
clf = tree.DecisionTreeClassifier()
clf.fit(Xtrain,Ytrain)
score=clf.score(Xtest,Ytest)
print(score)
(2)KMeans聚类
from numpy import unique
from numpy import where
from sklearn.cluster import KMeans,MiniBatchKMeans,DBSCAN,AgglomerativeClustering,Birch
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
from sklearn import metrics
import pandas as pd
import numpy as np
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
def minibatchKmeans(X,k,p=False):
if p==True:
for index, kk in enumerate((3,4,5,6)):
plt.subplot(2,2,index+1)
y_pred = MiniBatchKMeans(n_clusters=kk).fit_predict(X)
score= metrics.calinski_harabasz_score(X, y_pred)
plt.scatter(X[:, 0], X[:, 1], c=y_pred)
plt.text(.99, .01, ('k=%d, score: %.2f' % (kk,score)),
transform=plt.gca().transAxes, size=10,
horizontalalignment='right')
plt.show()
else:
y_pred = KMeans(n_clusters=k).fit_predict(X)
clusters = unique(y_pred)
indexdict ={}
for i in clusters:
indexarr = np.where(y_pred[:]==i)
indexdict[i] = indexarr[0]
return indexdict
def P_Kmeans(X,k,p=False):
if p==True:
for index, kk in enumerate((3,4,5,6)):
plt.subplot(2,2,index+1)
y_pred = KMeans(n_clusters=kk).fit_predict(X)
score= metrics.calinski_harabasz_score(X, y_pred)
plt.scatter(X[:, 0], X[:, 1], c=y_pred)
plt.text(.99, .01, ('k=%d, score: %.2f' % (kk,score)),
transform=plt.gca().transAxes, size=10,
horizontalalignment='right')
plt.show()
else:
y_pred = KMeans(n_clusters=k).fit_predict(X)
clusters = unique(y_pred)
indexdict ={}
for i in clusters:
indexarr = np.where(y_pred[:]==i)
indexdict[i] = indexarr[0]
return indexdict
if __name__ =="__main__":
train = pd.read_excel('./data/train.xlsx')
train = train.values
scaler = StandardScaler()
X = scaler.fit_transform(X_out)
k = 3
indexdict = P_Kmeans(X,k,True)
(3)回归树
from sklearn import tree
from sklearn import tree
from sklearn.model_selection import train_test_split
train = pd.read_csv('data.csv')
Xtrain,Xtest,Ytrain,Ytest=train_test_split(train.data,train.target,test_size=0.3)
clf = tree.DecisionTreeRegressor()
clf = clf.fit(Xtrain, Ytrain)
clf.predict(Xtest)
5 模型训练
5.1 基本理论
模型训练,需要考虑三个问题,数据集划分、参数选择、调参。数据划分将在以下的模型验证部分讲解,对于训练参数和模型参数的选择,在机器学习算法中,首先用默认参数去跑通模型,再通过调参优化模型。对于模型调参,一般采用网格搜索方法。这是一种穷举搜索的调参手段,在所有候选的参数选择中欧,循环遍历,尝试每一种可能性,表现最好的参数就是最终选择。
5.2 MATLAB实现
略
5.3 Python实现
(1)网格搜索调参举例
from sklearn.datasets import load_iris
from sklearn.svm import SVM
form sklearn.model_selection import train_test_split
iris = load_iris()
Xtrain,Xtest,Ytrain,Ytest=train_test_split(iris.data,iris.target,test_size=0.3)
best_score = 0
for g in [0.001,0.01,0.1,1,10,100]:
for c in [0.001,0.01,0.1,1,10,100]:
svm =SVM(gamma=g,C=c)
svm.fit(Xtrain,Ytrain)
score =svm.score(Xtest,Ytest)
if score>best_socre:
best_score =score
best_para = {'gamma':g,'C',c}
print('best score:{}'.format(best_socre))
print('best parameters,gamma:{},C:{}'.format(best_para['g'],best_para['c']))
6 模型验证
6.1 基本理论
(1)本地验证
模型的验证一般先通过划分训练集和测试集去线下验证,社会性的比赛,主办方会提供为标注的测试集,以该测试集的线上平台验证得分为准。划分训练集和测试集的方法就有多种
-
K折交叉验证划分
-
留出法划分
-
对抗验证划分 -
自助法划分
(2)评价指标 根据不同的模型模型模式选择。
-
分类:AUC、准确率Accuracy、F1-score、混淆矩阵、查准率、查全率、ROC曲线、PR曲线 -
聚类:常见的评价指标有:纯度(Purity)、兰德系数(Rand Index, RI)、F值(F-score)和调整兰德系数(Adjusted Rand Index,ARI) -
预测:MSE、RMSE、MAE、MAPE -
关联度分析:灰色关联分析的基本思想是,根据序列曲线几何形状的相似程度来判断其联系是否紧密。曲线越接近,相应序列之间的关联度就越大,反之就越小。
6.2 MATLAB实现
待完善
6.3 Python实现
(1)划分数据集
from sklearn.datasets import load_iris
from sklearn.model_selection import StratifiedKFold,cross_val_score,KFold,train_test_split
from sklearn.linear_model import LogisticRegression
iris = load_iris()
print('Iris labels:\n{}'.format(iris.target))
logreg = LogisticRegression()
strKFold = StratifiedKFold(n_splits=3,shuffle=False,random_state=0)
scores = cross_val_score(logreg,iris.data,iris.target,cv=strKFold)
strKFold = KFold(n_splits=3,shuffle=False,random_state=0)
scores = cross_val_score(logreg,iris.data,iris.target,cv=strKFold)
Xtrain,Xtest,Ytrain,Ytest=train_test_split(iris.data,iris.target,test_size=0.3)
(2)评价指标
from sklearn.metrics import f1_score
y_true = [0, 1, 2, 0, 1, 2]
y_pred = [0, 2, 1, 0, 0, 1]
f1_score(y_true, y_pred, average='macro')
from sklearn.datasets import load_breast_cancer
from sklearn.linear_model import LogisticRegression
from sklearn.metrics import roc_auc_score
X, y = load_breast_cancer(return_X_y=True)
clf = LogisticRegression(solver="liblinear", random_state=0).fit(X, y)
roc_auc_score(y, clf.predict_proba(X)[:, 1])
7 模型改进
7.1 特征优化
好的特征对于模型性能有着至关重要的影响,可以通过合成特征、对特征进行简单变换、用决策树创造新特征、特征组合等方法进行特征优化 (1)合成特征 合成特征是指不在输入特征之列,而是从一个或多个输入特征衍生而来的特征。通过标准化或缩放创造的特征不属于合成特征,主要包括以下类型:
- 将一个特征与其本身或其他特征相乘
- 两个特征相除
- 对连续特征进行分桶(分箱),以分为多个区间分箱。
(2) 特征的简单变换 数值特征的变换和组合 特征的线性组合仅仅适用于决策树算法,因为树模型不擅长捕获不同特征之间的相关性而SVM、线性回归、神经网络等模型自身可以线性组合。常用的数值特征的变化和组合如下
- 多项式特征
- 比例特征
- 绝对值
- Max(X1,X2)、Min(X1,X2)
类别特征与数值特征的组合 用N1和N2表示数值特征,用C1和C2表示类别特征,利用pandas的groupy操作可以创造出以下几种有意义的新特征(其中,C2还可以表示离散化的N1)
- 中位数:median(N1)_by(C1)
- 算术平均数:mean(N1)_by(C1)
- 众数 :model(N1)_by(C1)
- 最小值:min(N1)_by(C1)
- 最大值:max(N1)_by(C1)
- 标准差:std(N1)_by(C1)
- 方差:var(N1)_by(C1)
- 频数:freq(C2)_(C1)
仅仅将已有的类别特征和数值特征进行以上的有效组合,就能增加大量优秀的可用特征,如果将这种方法和线性组合等基础特征工程方法结合(仅适用于决策树),则可以得到更多有意义的特征,如
- N1-median(N1)_by(C1)
- N1-mean(N1)_by(C1)
(3)用决策树创造新特征 在决策树系列(单颗决策树、GBDT、随机森林)的算法中,由于每一个样本都会被映射到决策树的一片叶子上,因此我们可以把样本经过每一刻决策树映射后的index或one-hot-vector作为新的一项特征加入模型中。 具体实现可以采用apply()方法和decision_path()方法,其中sklearn和xgboost中都可以用。
7.2 模型融合
模型融合、即先产生一组个体学习器,再采用某种策略将它们结合起来,以加强模型效果。按照个体学习器的关系,模型融合提升技术可以分为两类
- 个体学习器间不存在强依赖关系可同时生成的并行化方法,代表是Bagging方法和随机森林
- 个体学习器间存在强依赖关系必须串行生成的序列化方法,代表是Boosting方法
7.3 数据增强
略
8 完整实例
待完善
参考资料
-
【Kaggle 数据挖掘比赛经验分享】https://ask.hellobi.com/blog/shuzhiwuyu/35204 -
【数据挖掘与生活:算法分类和应用】https://cloud.tencent.com/developer/article/1105310 -
【数据挖掘的10大算法我用大白话讲清楚了,新手一看就懂】https://cloud.tencent.com/developer/news/641827
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