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[人工智能]制作用于分割的带掩码的coco格式的数据集

大致原理

处理医学图像最常见的是MRI格式,但是MRI是三维的,如果想用detecron2或者maskrcnn跑类似的三维图片需要先进行切片,然后为切片制作coco格式的json文件,下面我们就来介绍一下如何把三维图像转成二维的,并为二维切片制作json文件。

本教程同样适用于二维图片,只是少了一个三维切片的过程。

大致原理就是:

  • 把三维的原始MRI标注文件切片
  • 依次处理每一张切片,因为我的任务是一个多分类的任务,所以每一张图片上都有多个类别。处理的时候,要单独处理每一个类别,为每一个类别生成对应的mask
  • 如何生成mask? 底层实现的时候调用contour函数,这个函数可以把一个二值图像中值为1的区域轮廓表示出来,也就是coco数据格式中的mask数组。

参考教程

COCO数据集–分割数据定义及标注信心
将彩色RGB分割标注图像数据集转换为COCO格式的json文件
外国官方教程(推荐)

安装pycococreator遇到的问题

在windows安装pycococreator时可能会报编译器版本低的错误,这是下只需要下载一个visual studio installer 安装一下编译器即可,安装的时候要选择如下几个选项
在这里插入图片描述

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加:2021-11-30 15:37:27  更:2021-11-30 15:38:16 
 
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