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生物分子互作基础 ,蛋白数据库 PDB 数据库介绍以及使用,蛋白结构分析 Pymol 软件介绍以及使用,同源建模 Swiss-Model ,小分子构建 ChemDraw软件,小分子化合物库 天然产物、中药成分数据库介绍及使用生物分子互作用 分子对接软件（Autodock)使用 半柔性对接 对接结果评价,虚拟筛选 柔性对接 分子对接用于虚拟筛选（Autodock),生物分子互作用II 预测蛋白-蛋白相互作,构效关系分析 3D-QSAR模型构建.Sybyl软件,分子动力学模拟
薛定谔专题
1.分子对接基础、原理及对接软件介绍
2.分子对接软件（薛定谔) 使用
3.基于结构的虚拟筛选（薛定谔）
4.共价对接（薛定谔）
5.药效团构建虚拟筛选（薛定谔）及结果分析
6.构效关系模型（3D-QSAR）构建及化合物活性分析
代谢组学及网络药理学
一、代谢组学研究技术与实践
1.代谢组学数据采集与预处理
2.基于SIMCA-P软件的代谢组学数据多元统计分析与实操
二、网络药理学研究技术与实践
1.网络药理学数据分析与实操
2.化学成分的获取与筛选
3.中药化学成分靶点获取
4.疾病靶点富集数据库
5.化合物与疾病靶点映射
6.PPI网络分析，富集分析
三、代谢组学与网络药理学结合研究技术与实践
1.代谢组学与网络药理学数据的获取
2.代谢组学功能分析，代谢小分子网络关联分析
3.代谢组学与网络药理学功能层次关联分析
1.中药化学成分靶点与代谢小分子网络分析实例
2.代谢组学与网络药理学功能层次关联分析实例
3.代谢组学和网络药理关联分析实例
AMBER分子动力学模拟
一.分子动力学入门理论
二.LINUX入门
三.AMBER简介及安装
7模型文件的预处理
8能量优化、分子动力学模拟
9焓变计算
10熵变计算
113D可视化分析
12构象分析
13能量分析
14经典文献工作复现
人工智能药物设计
一：分子表征及特征提取： 分子描述符和分子指纹软件
SMILES、RDKit、 OpenBabe、ChemDes、PyBioMed等
二：结构、数据预处理
三：常用人工智能药物设计算法和软件： 算法简单介绍和分类、KNIME软件介绍、特征选择;基于sklearn的特征选择，基于KNIME流程的特征选择
回归模型，分类模型的评价指标,应用域的评估，基于树的模型的解释
7. 模型的评价与解释
四：类药性和ADMET评价实践：ADMET介绍、KNIME软件构建ADMET模型、ADMET计算软件和实操
五：GRK2抑制剂筛选实践： 噪声过滤和相似性搜索、机器学习模型构建和预测、 分子对接、 ADMET评估
新药化合物的虚拟筛选技术
一：全新先导化合物的筛选策略：筛选策略的基本原理–药效团及分子对接化合物的筛选方法
二：小分子数据库的构建：小分子数据库的构建及类药性筛选（三维数据库）
三：蛋白质结构数据库（PDB）
四：分子对接过程及结果分析：（实例：分子对接筛选磷酸二酯酶-4小分子抑制剂等）
五：同源建模：（实例新冠病毒3CL水解酶为靶点的同源建模）
六：基于受体的药效团建模实践
七：基于配体的药效团建模实践
八：多肽药物的虚拟筛选
九：抗肿瘤药物先导化合物的发现
十：抗病毒药物先导化合物的发现
十一：针对建立和设计属于自己关心的药物设计先导化合物的筛选策略
收录：VX:1047608967
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