IT数码 购物 网址 头条 软件 日历 阅读 图书馆
TxT小说阅读器
↓语音阅读,小说下载,古典文学↓
图片批量下载器
↓批量下载图片,美女图库↓
图片自动播放器
↓图片自动播放器↓
一键清除垃圾
↓轻轻一点,清除系统垃圾↓
开发: C++知识库 Java知识库 JavaScript Python PHP知识库 人工智能 区块链 大数据 移动开发 嵌入式 开发工具 数据结构与算法 开发测试 游戏开发 网络协议 系统运维
教程: HTML教程 CSS教程 JavaScript教程 Go语言教程 JQuery教程 VUE教程 VUE3教程 Bootstrap教程 SQL数据库教程 C语言教程 C++教程 Java教程 Python教程 Python3教程 C#教程
数码: 电脑 笔记本 显卡 显示器 固态硬盘 硬盘 耳机 手机 iphone vivo oppo 小米 华为 单反 装机 图拉丁
 
   -> 大数据 -> NCBI数据库—上传16S rRNA测序数据 -> 正文阅读

[大数据]NCBI数据库—上传16S rRNA测序数据

NCBI上传16S rRNA测序数据

1.登陆NCBI官网

NCBI官网链接
在这里插入图片描述

2.选择上传序列类型

上传16S rRNA测序数据,直接选16S rRNA就可以,然后弹出上传数据集的类型,选择SRA
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述

3.注册NCBI账号

选择SRA后,会弹出如下的一些提示信息,直接选择submit即可;
在这里插入图片描述

3.1 进入提交信息页面

进入正式提交信息的页面;注意此处的“My submissions”选项,注册完账号后,仍需返回这里

3.2 注册NCBI账号

选择右上角的登陆账号—>选择ORCID登陆/注册(已经申请过账号可以直接登陆,没有申请则需要注册依次填写个人信息,个人信息如实填写就可以)—>注册完,后返回本界面,找到 “My submissions”选择。
在这里插入图片描述

4. 提交信息

4.1. 提交者信息完成

根据网页上方显示的顺序,依次填写

  • 带星号为必填选项,填写完毕后直接点击"Continue"进入下一项
    在这里插入图片描述

4.2. 基因序列信息

  • 根据每个选项的要求如实填写就好(下图分别为中英文展示)
    在这里插入图片描述
    在这里插入图片描述
    注:发布日期即为自己上传的测序序列公开的时间,一般自上传日期起至三个月即可。

4.3. 项目信息

  • 项目名称可以根据返回的测序文件命名(避免与之后上传命名重复);项目描述只要写清楚就行(测序区间,样品类型,测序设备等)
    在这里插入图片描述

4.4.生物样品类型

  • 此处只需要选择生物样品类型即可
    在这里插入图片描述
    活性污泥样品就直接选择“Metagenome or environmental”—>点击“Continue”进入下一步
    在这里插入图片描述

4.5. 生物样本属性

  • 只需要对标注“*”,“ ** ”的填写即可。
    其中"Sample Name"直接填写送样时的样品名称,日期最好一个样品名称配一个日期,之前填写的相同的日期,一直显示存在“Error”。其他选项直接按照下列模板填写即可。
    在这里插入图片描述

4.6. SRA元数据

  • 这里除“Sample Name”,“Filename”自己填写之外,其余部分直接按照下列模板填写即可。注意:“Filename”命名需要填写上传文件名的全部名称(包括后缀名)。例如:上传文件名为:zzx.fastq,则“Filename”命名也需要写为:zzx.fastq,而不是zzx。
  • 点击提交后显示不成功,可以再修改一下Filename选项,填到“Filename2”,多次点击"Continue",即可进入下一步
    在这里插入图片描述

4.7. Files提交

  • 选择网页提交—>挨个上传原始数据文件夹中的combined_fq.rar里面单个数据文件(可以一次加入三四个文件,防止断网)—>Autofinish submission。等待数据上传完成。
    在这里插入图片描述
    显示下列界面则表示传输完成,点击"Continue"进入下一步
    在这里插入图片描述

4.8. Review and Submit

  • 点击“Continue”后出现下列界面。则说明提交成功,等待几天后接收SRA号即可
    在这里插入图片描述
  大数据 最新文章
实现Kafka至少消费一次
亚马逊云科技:还在苦于ETL?Zero ETL的时代
初探MapReduce
【SpringBoot框架篇】32.基于注解+redis实现
Elasticsearch:如何减少 Elasticsearch 集
Go redis操作
Redis面试题
专题五 Redis高并发场景
基于GBase8s和Calcite的多数据源查询
Redis——底层数据结构原理
上一篇文章      下一篇文章      查看所有文章
加:2021-10-01 16:56:57  更:2021-10-01 16:58:10 
 
开发: C++知识库 Java知识库 JavaScript Python PHP知识库 人工智能 区块链 大数据 移动开发 嵌入式 开发工具 数据结构与算法 开发测试 游戏开发 网络协议 系统运维
教程: HTML教程 CSS教程 JavaScript教程 Go语言教程 JQuery教程 VUE教程 VUE3教程 Bootstrap教程 SQL数据库教程 C语言教程 C++教程 Java教程 Python教程 Python3教程 C#教程
数码: 电脑 笔记本 显卡 显示器 固态硬盘 硬盘 耳机 手机 iphone vivo oppo 小米 华为 单反 装机 图拉丁

360图书馆 购物 三丰科技 阅读网 日历 万年历 2024年11日历 -2024/11/23 23:20:12-

图片自动播放器
↓图片自动播放器↓
TxT小说阅读器
↓语音阅读,小说下载,古典文学↓
一键清除垃圾
↓轻轻一点,清除系统垃圾↓
图片批量下载器
↓批量下载图片,美女图库↓
  网站联系: qq:121756557 email:121756557@qq.com  IT数码