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[大数据]搭建Spark所遇过的坑

一.经验
1.Spark Streaming包含三种计算模式:nonstate .stateful .window

2.kafka可通过配置文件使用自带的zookeeper集群

3.Spark一切操作归根结底是对RDD的操作

4.部署Spark任务,不用拷贝整个架包,只需拷贝被修改的文件,然后在目标服务器上编译打包。

5.kafka的log.dirs不要设置成/tmp下的目录,貌似tmp目录有文件数和磁盘容量限制

6.ES的分片类似kafka的partition

7spark Graph根据边集合构建图,顶点集合只是指定图中哪些顶点有效

8.presto集群没必要采用on yarn模式,因为hadoop依赖HDFS,如果部分机器磁盘很小,hadoop会很尴尬,而presto是纯内存计算,不依赖磁盘,独立安装可以跨越多个集群,可以说有内存的地方就可以有presto

9.presto进程一旦启动,JVM server会一直占用内存

10.如果maven下载很慢,很可能是被天朝的GFW墙了,可以在maven安装目录的setting.conf配置文件mirrors标签下加入国内镜像抵制**党的网络封锁,例如:

nexus-aliyun * Nexus aliyun http://maven.aliyun.com/nexus/content/groups/public 11.编译spark,hive on spark就不要加-Phive参数,若需sparkSQL支持hive语法则要加-Phive参数

12.通过hive源文件pom.xml查看适配的spark版本,只要打版本保持一致就行,例如spark1.6.0和1.6.2都能匹配

13.打开Hive命令行客户端,观察输出日志是否有打印“SLF4J: Found binding in [jar:file:/work/poa/hive-2.1.0-bin/lib/spark-assembly-1.6.2-hadoop2.6.0.jar!/org/slf4j/impl/StaticLoggerBinder.class]”来判断hive有没有绑定spark

14.kafka的comsumer groupID对于spark direct streaming无效

15.shuffle write就是在一个stage结束计算之后,为了下一个stage可以执行shuffle类的算子,而将每个task处理的数据按key进行分类,将相同key都写入同一个磁盘文件中,而每一个磁盘文件都只属于下游stage的一个task,在将数据写入磁盘之前,会先将数据写入内存缓存中,下一个stage的task有多少个,当前stage的每个task就要创建多少份磁盘文件。

16.单个spark任务的excutor核数不宜设置过高,否则会导致其他JOB延迟

17.数据倾斜只发生在shuffle过程,可能触发shuffle操作的算子有:distinct, groupByKey, reduceByKey, aggregateByKey, join, cogroup, repartition等

18.运行时删除hadoop数据目录会导致依赖HDFS的JOB失效

19.sparkSQL UDAF中update函数的第二个参数 input: Row 对应的并非DataFrame的行,而是被inputSchema投影了的行

20.Spark的Driver只有在Action时才会收到结果

21.Spark需要全局聚合变量时应当使用累加器(Accumulator)

22.Kafka以topic与consumer group划分关系,一个topic的消息会被订阅它的消费者组全部消费,如果希望某个consumer使用topic的全部消息,可将该组只设一个消费者,每个组的消费者数目不能大于topic的partition总数,否则多出的consumer将无消可费

23.所有自定义类要实现serializable接口,否则在集群中无法生效

24.resources资源文件读取要在Spark Driver端进行,以局部变量方式传给闭包函数

25.DStream流转化只产生临时流对象,如果要继续使用,需要一个引用指向该临时流对象

26.提交到yarn cluster的作业不能直接print到控制台,要用log4j输出到日志文件中

27.HDFS文件路径写法为:hdfs://master:9000/文件路径,这里的master是namenode的hostname,9000是hdfs端口号。

28.不要随意格式化HDFS,这会带来数据版本不一致等诸多问题,格式化前要清空数据文件夹

29.搭建集群时要首先配置好主机名,并重启机器让配置的主机名生效

30.linux批量多机互信, 将pub秘钥配成一个

31小于128M的小文件都会占据一个128M的BLOCK,合并或者删除小文件节省磁盘空间

32.Non DFS Used指的是非HDFS的所有文件

33.spark两个分区方法coalesce和repartition,前者窄依赖,分区后数据不均匀,后者宽依赖,引发shuffle操作,分区后数据均匀

34.spark中数据写入ElasticSearch的操作必须在action中以RDD为单位执行

35.可以通过hive-site.xml修改spark.executor.instances, spark.executor.cores, spark.executor.memory等配置来优化hive on spark执行性能,不过最好配成动态资源分配。

二.基本功能
0.常见问题:
1如果运行程序出现错误:Exception in thread “main” java.lang.NoClassDefFoundError: org/slf4j/LoggerFactory,这是因为项目缺少slf4j-api.jar和slf4j-log4j12.jar这两个jar包导致的错误。 2如果运行程序出现错误:java.lang.NoClassDefFoundError: org/apache/log4j/LogManager,这是因为项目缺少log4j.jar这个jar包 3错误:Exception in thread “main” java.lang.NoSuchMethodError: org.slf4j.MDC.getCopyOfContextMap()Ljava/util/Map,这是因为jar包版本冲突造成的。

1.配置spark-submit (CDH版本)
Exception in thread “main” java.lang.NoClassDefFoundError: org/apache/hadoop/fs/FSDataInputStream
at org.apache.spark.deploy.SparkSubmitArguments.handleUnknown(SparkSubmitArguments.scala:451)
at org.apache.spark.launcher.SparkSubmitOptionParser.parse(SparkSubmitOptionParser.java:178)
at org.apache.spark.deploy.SparkSubmitArguments.(SparkSubmitArguments.scala:97)
at org.apache.spark.deploy.SparkSubmit$.main(SparkSubmit.scala:113)
at org.apache.spark.deploy.SparkSubmit.main(SparkSubmit.scala)
Caused by: java.lang.ClassNotFoundException: org.apache.hadoop.fs.FSDataInputStream
at java.net.URLClassLoader$1.run(URLClassLoader.java:366)
at java.net.URLClassLoader 1. r u n ( U R L C l a s s L o a d e r . j a v a : 355 ) a t j a v a . s e c u r i t y . A c c e s s C o n t r o l l e r . d o P r i v i l e g e d ( N a t i v e M e t h o d ) a t j a v a . n e t . U R L C l a s s L o a d e r . f i n d C l a s s ( U R L C l a s s L o a d e r . j a v a : 354 ) a t j a v a . l a n g . C l a s s L o a d e r . l o a d C l a s s ( C l a s s L o a d e r . j a v a : 425 ) a t s u n . m i s c . L a u n c h e r 1.run(URLClassLoader.java:355) at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method) at java.net.URLClassLoader.findClass(URLClassLoader.java:354) at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:425) at sun.misc.Launcher 1.run(URLClassLoader.java:355)atjava.security.AccessController.doPrivileged(NativeMethod)atjava.net.URLClassLoader.findClass(URLClassLoader.java:354)atjava.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:425)atsun.misc.LauncherAppClassLoader.loadClass(Launcher.java:308)
at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:358)
… 5 more
解决方案:
在spark-env.sh文件中添加:

export SPARK_DIST_CLASSPATH=$(hadoop classpath)

2.启动spark-shell时,报错
INFO cluster.YarnClientSchedulerBackend: Registered executor: Actor[akka.tcp://sparkExecutor@services07:34965/user/Executor#1736210263] with ID 1
INFO util.RackResolver: Resolved services07 to /default-rack
INFO storage.BlockManagerMasterActor: Registering block manager services07:51154 with 534.5 MB RAM
解决方案:
在spark的spark-env配置文件中配置下列配置项:

将export SPARK_WORKER_MEMORY, export SPARK_DRIVER_MEMORY, export SPARK_YARN_AM_MEMORY的值设置成小于534.5 MB

3.启动spark SQL时,报错:
Caused by: org.datanucleus.store.rdbms.connectionpool.DatastoreDriverNotFoundException: The specified datastore driver ("com.mysql.jdbc.Driver ") was not found in the CLASSPATH. Please check your CLASSPATH specification, and the name of the driver.
解决方案:
在$SPARK_HOME/conf/spark-env.sh文件中配置:

export SPARK_CLASSPATH=$HIVE_HOME/lib/mysql-connector-java-5.1.6-bin.jar

4.启动spark SQL时,报错:
java.sql.SQLException: Access denied for user 'services02 '@‘services02’ (using password: YES)
解决方案:
检查hive-site.xml的配置项, 有以下这个配置项

javax.jdo.option.ConnectionPassword 123456 password to use against metastore database 看该密码与与MySQL的登录密码是否一致

5.启动计算任务时报错:
报错信息为:

org.apache.spark.rpc.RpcTimeoutException: Futures timed out after [120 seconds]. This timeout is controlled by spark.rpc.askTimeout
解决方案:
分配的core不够, 多分配几核的CPU

6.启动计算任务时报错:
不断重复出现

status.SparkJobMonitor: 2017-01-04 11:53:51,564 Stage-0_0: 0(+1)/1
status.SparkJobMonitor: 2017-01-04 11:53:54,564 Stage-0_0: 0(+1)/1
status.SparkJobMonitor: 2017-01-04 11:53:55,564 Stage-0_0: 0(+1)/1
status.SparkJobMonitor: 2017-01-04 11:53:56,564 Stage-0_0: 0(+1)/1
解决方案:
资源不够, 分配大点内存, 默认值为512MB.

7.启动Spark作为计算引擎时报错:
报错信息为:

java.io.IOException: Failed on local exception: java.nio.channels.ClosedByInterruptException; Host Details : local host is: “m1/192.168.179.201”; destination host is: “m1”:9000;
at org.apache.hadoop.net.NetUtils.wrapException(NetUtils.java:772)
at org.apache.hadoop.ipc.Client.call(Client.java:1474)
Caused by: java.nio.channels.ClosedByInterruptException
at java.nio.channels.spi.AbstractInterruptibleChannel.end(AbstractInterruptibleChannel.java:202)
at sun.nio.ch.SocketChannelImpl.connect(SocketChannelImpl.java:681)
17/01/06 11:01:43 INFO retry.RetryInvocationHandler: Exception while invoking getFileInfo of class ClientNamenodeProtocolTranslatorPB over m2/192.168.179.202:9000 after 9 fail over attempts. Trying to fail over immediately.
解决方案:
出现该问题的原因有多种, 我所遇到的是使用Hive On Spark时报了此错误,解决方案是: 在hive-site.xml文件下正确配置该项

spark.yarn.jar hdfs://ns1/Jar/spark-assembly-1.6.0-hadoop2.6.0.jar

8.启动spark集群时报错,启动命令为:start-mastersh
报错信息:

Exception in thread “main” java.lang.NoClassDefFoundError: org/slf4j/Logger
at java.lang.Class.getDeclaredMethods0(Native Method)
at java.lang.Class.privateGetDeclaredMethods(Class.java:2701)
at java.lang.Class.privateGetMethodRecursive(Class.java:3048)
at java.lang.Class.getMethod0(Class.java:3018)
at java.lang.Class.getMethod(Class.java:1784)
at sun.launcher.LauncherHelper.validateMainClass(LauncherHelper.java:544)
at sun.launcher.LauncherHelper.checkAndLoadMain(LauncherHelper.java:526)
Caused by: java.lang.ClassNotFoundException: org.slf4j.Logger
at java.net.URLClassLoader.findClass(URLClassLoader.java:381)
at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:424)
at sun.misc.Launcher$AppClassLoader.loadClass(Launcher.java:331)
at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:357)
… 7 more
解决方案:
将/home/centos/soft/hadoop/share/hadoop/common/lib目录下的slf4j-api-1.7.5.jar文件,slf4j-log4j12-1.7.5.jar文件和commons-logging-1.1.3.jar文件拷贝到/home/centos/soft/spark/lib目录下

9.启动spark集群时报错,启动命令为:start-mastersh
报错信息:

Exception in thread “main” java.lang.NoClassDefFoundError: org/apache/hadoop/conf/Configuration
at java.lang.Class.getDeclaredMethods0(Native Method)
at java.lang.Class.privateGetDeclaredMethods(Class.java:2570)
at java.lang.Class.getMethod0(Class.java:2813)
at java.lang.Class.getMethod(Class.java:1663)
at sun.launcher.LauncherHelper.getMainMethod(LauncherHelper.java:494)
at sun.launcher.LauncherHelper.checkAndLoadMain(LauncherHelper.java:486)
Caused by: java.lang.ClassNotFoundException: org.apache.hadoop.conf.Configuration
at java.net.URLClassLoader$1.run(URLClassLoader.java:366)
at java.net.URLClassLoader 1. r u n ( U R L C l a s s L o a d e r . j a v a : 355 ) a t j a v a . s e c u r i t y . A c c e s s C o n t r o l l e r . d o P r i v i l e g e d ( N a t i v e M e t h o d ) a t j a v a . n e t . U R L C l a s s L o a d e r . f i n d C l a s s ( U R L C l a s s L o a d e r . j a v a : 354 ) a t j a v a . l a n g . C l a s s L o a d e r . l o a d C l a s s ( C l a s s L o a d e r . j a v a : 425 ) a t s u n . m i s c . L a u n c h e r 1.run(URLClassLoader.java:355) at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method) at java.net.URLClassLoader.findClass(URLClassLoader.java:354) at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:425) at sun.misc.Launcher 1.run(URLClassLoader.java:355)atjava.security.AccessController.doPrivileged(NativeMethod)atjava.net.URLClassLoader.findClass(URLClassLoader.java:354)atjava.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:425)atsun.misc.LauncherAppClassLoader.loadClass(Launcher.java:308)
at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:358)
… 6 more
解决方案:
官网资料:
https://spark.apache.org/docs/latest/hadoop-provided.html#apache-hadoop
编辑/home/centos/soft/spark/conf/spark-env.sh文件,配置下列配置项:

export SPARK_DIST_CLASSPATH=$(/home/centos/soft/hadoop/bin/hadoop classpath)

10.启动HPL/SQL存储过程时报错:
报错信息:

2017-01-10T15:20:18,491 ERROR [HiveServer2-Background-Pool: Thread-97] exec.TaskRunner: Error in executeTask
java.lang.OutOfMemoryError: PermGen space
at java.lang.ClassLoader.defineClass1(Native Method)
at java.lang.ClassLoader.defineClass(ClassLoader.java:800)
2017-01-10T15:20:18,491 ERROR [HiveServer2-Background-Pool: Thread-97] ql.Driver: FAILED: Execution Error, return code -101 from org.apache.hadoop.hive.ql.exec.spark.SparkTask. PermGen space
2017-01-10T15:20:18,491 INFO [HiveServer2-Background-Pool: Thread-97] ql.Driver: Completed executing command(queryId=centos_20170110152016_240c1b5e-3153-4179-80af-9688fa7674dd); Time taken: 2.113 seconds
2017-01-10T15:20:18,500 ERROR [HiveServer2-Background-Pool: Thread-97] operation.Operation: Error running hive query:
org.apache.hive.service.cli.HiveSQLException: Error while processing statement: FAILED: Execution Error, return code -101 from org.apache.hadoop.hive.ql.exec.spark.SparkTask. PermGen space
at org.apache.hive.service.cli.operation.Operation.toSQLException(Operation.java:388)
at org.apache.hive.service.cli.operation.SQLOperation.runQuery(SQLOperation.java:244)
at org.apache.hive.service.cli.operation.SQLOperation.access$800(SQLOperation.java:91)
Caused by: java.lang.OutOfMemoryError: PermGen space
at java.lang.ClassLoader.defineClass1(Native Method)
at java.lang.ClassLoader.defineClass(ClassLoader.java:800)
解决方案:
参考资料:
http://blog.csdn.net/xiao_jun_0820/article/details/45038205
出现该问题是因为Spark默认使用全部资源, 而此时主机的内存已用, 应在Spark配置文件中限制内存的大小. 在hive-site.xml文件下配置该项:

spark.driver.extraJavaOptions -XX:PermSize=128M -XX:MaxPermSize=512M 或在spark-default.conf文件下配置:

spark.driver.extraJavaOptions -XX:PermSize=128M -XX:MaxPermSize=256M

三.Spark常见问题汇总
1.报错信息:
Operation category READ is not supported in state standbyorg.apache.hadoop.ipc.RemoteException(org.apache.hadoop.ipc.StandbyException):
Operation category READ is not supported in state standby
解决方案:
查看执行Spark计算的是否处于standby状态, 用浏览器访问该主机:http://m1:50070, 如果处于standby状态, 则不可在处于StandBy机器运行spark计算,应切执行Spark计算的主机从Standby状态切换到Active状态

2.问题出现情景:
Spakr集群的所有运行数据在Master重启是都会丢失

解决方案:
配置spark.deploy.recoveryMode选项为ZOOKEEPER

3.报错信息:
由于Spark在计算的时候会将中间结果存储到/tmp目录,而目前linux又都支持tmpfs,其实就是将/tmp目录挂载到内存当中, 那么这里就存在一个问题,中间结果过多导致/tmp目录写满而出现如下错误

No Space Left on the device(Shuffle临时文件过多)
解决办法:
修改配置文件spark-env.sh,把临时文件引入到一个自定义的目录中去, 即:

export SPARK_LOCAL_DIRS=/home/utoken/datadir/spark/tmp

4.报错信息:
java.lang.OutOfMemory, unable to create new native thread
Caused by: java.lang.OutOfMemoryError: unable to create new native thread
at java.lang.Thread.start0(Native Method)
at java.lang.Thread.start(Thread.java:640)
解决方案:
上面这段错误提示的本质是Linux操作系统无法创建更多进程,导致出错,并不是系统的内存不足。因此要解决这个问题需要修改Linux允许创建更多的进程,就需要修改Linux最大进程数。 (1)修改Linux最大进程数

ulimit -a
(2)临时修改允许打开的最大进程数

ulimit -u 65535
(3)临时修改允许打开的文件句柄

ulimit -n 65535
(4)永久修改Linux最大进程数量

sudo vi /etc/security/limits.d/90-nproc.conf

  •      soft    nproc     60000
    

root soft nproc unlimited
永久修改用户打开文件的最大句柄数,该值默认1024,一般都会不够,常见错误就是not open file 解决办法:

sudo vi /etc/security/limits.conf
bdata soft nofile 65536
bdata hard nofile 65536

5.问题出现情景:
Worker节点中的work目录占用许多磁盘空间, 这些是Driver上传到worker的文件, 会占用许多磁盘空间.

解决方案:
需要定时做手工清理. 目录地址:/home/centos/soft/spark/work

6.问题出现情景:
spark-shell提交Spark Application如何解决依赖库

解决方案:
利用–driver-class-path选项来指定所依赖的jar文件,注意的是–driver-class-path后如果需要跟着多个jar文件的话,jar文件之间使用冒号:来分割。

7.Spark在发布应用的时候,出现连接不上master
报错信息如下:

INFO AppClient$ClientEndpoint: Connecting to master spark://s1:7077…
WARN ReliableDeliverySupervisor: Association with remote system [akka.tcp://sparkMaster@s1:7077] has failed, address is now gated for [5000] ms. Reason: [Disassociated]
解决方案:
检查所有机器时间是否一致.hosts是否都配置了映射.客户端和服务器端的Scala版本是否一致.Scala版本是否和Spark兼容

8.开发spark应用程序(和Flume-NG结合时)发布应用时可能会报错
报错信息如下:

ERROR ReceiverSupervisorImpl: Stopped receiver with error: org.jboss.netty.channel.ChannelException: Failed to bind to: /192.168.10.156:18800
ERROR Executor: Exception in task 0.0 in stage 2.0 (TID 70)
org.jboss.netty.channel.ChannelException: Failed to bind to: /192.168.10.156:18800
at org.jboss.netty.bootstrap.ServerBootstrap.bind(ServerBootstrap.java:272)
Caused by: java.net.BindException: Cannot assign requested address
解决方案:
参考资料:
http://www.tuicool.com/articles/Yfi2eyR
由于spark通过Master发布的时候,会自动选取发送到某一台的worker节点上,所以这里绑定端口的时候,需要选择相应的worker服务器,但是由于我们无法事先了解到,spark发布到哪一台服务器的,所以这里启动报错,是因为在192.168.10.156:18800的机器上面没有启动Driver程序,而是发布到了其他服务器去启动了,所以无法监听到该机器出现问题,所以我们需要设置spark分发包时,发布到所有worker节点机器,或者发布后,我们去寻找发布到了哪一台机器,重新修改绑定IP,重新发布,有一定几率发布成功。

9.使用Hive on Spark时报错:
ERROR XSDB6: Another instance of Derby may have already booted the database /home/bdata/data/metastore_db.
解决方案:
在使用Hive on Spark模式操作hive里面的数据时,报以上错误,原因是因为HIVE采用了derby这个内嵌数据库作为数据库,它不支持多用户同时访问,解决办法就是把derby数据库换成mysql数据库即可

10.找不到hdfs集群名字dfscluster
报错信息:

java.lang.IllegalArgumentException: java.net.UnknownHostException: dfscluster
解决办法:
H A D O O P H O M E / e t c / h a d o o p / h d f s ? s i t e . x m l 文件拷贝到 S p a r k 集群的所有主机的 HADOOP_HOME/etc/hadoop/hdfs-site.xml文件拷贝到Spark集群的所有主机的 HADOOPH?OME/etc/hadoop/hdfs?site.xml文件拷贝到Spark集群的所有主机的SPARK_HOME/conf目录下,然后重启Spark集群

cd /home/centos/soft/spark/conf/
for i in {201,202,203};
do scp hdfs-site.xml 192.168.179.$i:/home/centos/soft/spark/conf/;
done

11.在执行yarn集群或者客户端时,报错:
执行指令:

sh $SPARK_HOME/bin/spark-sql --master yarn-client
报如下错误:

Exception in thread “main” java.lang.Exception: When running with master ‘yarn-client’ either HADOOP_CONF_DIR or YARN_CONF_DIR must be set in the environment.
解决办法:
根据提示,配置HADOOP_CONF_DIR or YARN_CONF_DIR的环境变量即可, 在spark-env.sh文件中配置以下几项:

export HADOOP_HOME=/u01/hadoop-2.6.1
export HADOOP_CONF_DIR= H A D O O P H O M E / e t c / h a d o o p P A T H = HADOOP_HOME/etc/hadoop PATH= HADOOPH?OME/etc/hadoopPATH=PATH: H I V E H O M E / b i n : HIVE_HOME/bin: HIVEH?OME/bin:HADOOP_HOME/bin

12.提交spark计算任务时,报错:
报错信息如下:

Job aborted due to stage failure: Task 3 in stage 0.0 failed 4 times, most recent failure: Lost task 3.3 in
[org.apache.spark.scheduler.TaskSchedulerImpl]-[ERROR] Lost executor 0 on 192.168.10.38: remote Rpc client disassociated
[org.apache.spark.scheduler.TaskSchedulerImpl]-[ERROR] Lost executor 1 on 192.168.10.38: remote Rpc client disassociated
[org.apache.spark.scheduler.TaskSchedulerImpl]-[ERROR] Lost executor 2 on 192.168.10.38: remote Rpc client disassociated
[org.apache.spark.scheduler.TaskSchedulerImpl]-[ERROR] Lost executor 3 on 192.168.10.38: remote Rpc client disassociated
[org.apache.spark.scheduler.TaskSetManager]-[ERROR] Task 3 in stage 0.0 failed 4 times; aborting job
Exception in thread “main” org.apache.spark.SparkException : Job aborted due to stage failure: Task 3 in stage 0.0 failed 4 times, most recent failure: Lost task 3.3 in stage 0.0 (TID 14, 192.168.10.38): ExecutorLostFailure (executor 3 lost)
Driver stacktrace:
at org.apache.spark.scheduler.DAGScheduler.org a p a c h e apache apachespark s c h e d u l e r scheduler schedulerDAGScheduler$$failJobAndIndependentStages(DAGScheduler.scala:1283)
解决方案:
这里遇到的问题主要是因为数据源数据量过大,而机器的内存无法满足需求,导致长时间执行超时断开的情况,数据无法有效进行交互计算,因此有必要增加内存

13.启动Spark计算任务:
长时间等待无反应,并且看到服务器上面的web界面有内存和核心数,但是没有分配,报错信息如下:

status.SparkJobMonitor: 2017-01-04 11:53:51,564 Stage-0_0: 0(+1)/1
status.SparkJobMonitor: 2017-01-04 11:53:51,564 Stage-0_0: 0(+1)/1
status.SparkJobMonitor: 2017-01-04 11:53:51,564 Stage-0_0: 0(+1)/1
status.SparkJobMonitor: 2017-01-04 11:53:51,564 Stage-0_0: 0(+1)/1
status.SparkJobMonitor: 2017-01-04 11:53:51,564 Stage-0_0: 0(+1)/1
status.SparkJobMonitor: 2017-01-04 11:53:51,564 Stage-0_0: 0(+1)/1
日志信息显示:

WARN TaskSchedulerImpl: Initial job has not accepted any resources; check your cluster UI to ensure that workers are registered and have sufficient resources
解决方案:
出现上面的问题主要原因是因为我们通过参数spark.executor.memory设置的内存过大,已经超过了实际机器拥有的内存,故无法执行,需要等待机器拥有足够的内存后,才能执行任务,可以减少任务执行内存,设置小一些即可

14.内存不足或数据倾斜导致Executor Lost(spark-submit提交)
报错信息如下:

TaskSetManager: Lost task 1.0 in stage 6.0 (TID 100, 192.168.10.37): java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space
INFO BlockManagerInfo: Added broadcast_8_piece0 in memory on 192.168.10.37:57139 (size: 42.0 KB, free: 24.2 MB)
INFO BlockManagerInfo: Added broadcast_8_piece0 in memory on 192.168.10.38:53816 (size: 42.0 KB, free: 24.2 MB)
INFO TaskSetManager: Starting task 3.0 in stage 6.0 (TID 102, 192.168.10.37, ANY, 2152 bytes)
WARN TaskSetManager: Lost task 1.0 in stage 6.0 (TID 100, 192.168.10.37): java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space
at java.io.BufferedOutputStream.(BufferedOutputStream.java:76)
at java.io.BufferedOutputStream.(BufferedOutputStream.java:59)
at org.apache.spark.sql.execution.UnsafeRowSerializerInstance$$anon 2. < i n i t > ( U n s a f e R o w S e r i a l i z e r . s c a l a : 55 ) E R R O R T a s k S c h e d u l e r I m p l : L o s t e x e c u t o r 6 o n 192.168.10.37 : r e m o t e R p c c l i e n t d i s a s s o c i a t e d I N F O T a s k S e t M a n a g e r : R e ? q u e u e i n g t a s k s f o r 6 f r o m T a s k S e t 6.0 W A R N R e l i a b l e D e l i v e r y S u p e r v i s o r : A s s o c i a t i o n w i t h r e m o t e s y s t e m [ a k k a . t c p : / / s p a r k E x e c u t o r @ 192.168.10.37 : 42250 ] h a s f a i l e d , a d d r e s s i s n o w g a t e d f o r [ 5000 ] m s . R e a s o n : [ D i s a s s o c i a t e d ] W A R N T a s k S e t M a n a g e r : L o s t t a s k 3.0 i n s t a g e 6.0 ( T I D 102 , 192.168.10.37 ) : E x e c u t o r L o s t F a i l u r e ( e x e c u t o r 6 l o s t ) I N F O D A G S c h e d u l e r : E x e c u t o r l o s t : 6 ( e p o c h 8 ) I N F O B l o c k M a n a g e r M a s t e r E n d p o i n t : T r y i n g t o r e m o v e e x e c u t o r 6 f r o m B l o c k M a n a g e r M a s t e r . I N F O B l o c k M a n a g e r M a s t e r E n d p o i n t : R e m o v i n g b l o c k m a n a g e r B l o c k M a n a g e r I d ( 6 , 192.168.10.37 , 57139 ) I N F O B l o c k M a n a g e r M a s t e r : R e m o v e d 6 s u c c e s s f u l l y i n r e m o v e E x e c u t o r I N F O A p p C l i e n t 2.<init>(UnsafeRowSerializer.scala:55) ERROR TaskSchedulerImpl: Lost executor 6 on 192.168.10.37: remote Rpc client disassociated INFO TaskSetManager: Re-queueing tasks for 6 from TaskSet 6.0 WARN ReliableDeliverySupervisor: Association with remote system [akka.tcp://sparkExecutor@192.168.10.37:42250] has failed, address is now gated for [5000] ms. Reason: [Disassociated] WARN TaskSetManager: Lost task 3.0 in stage 6.0 (TID 102, 192.168.10.37): ExecutorLostFailure (executor 6 lost) INFO DAGScheduler: Executor lost: 6 (epoch 8) INFO BlockManagerMasterEndpoint: Trying to remove executor 6 from BlockManagerMaster. INFO BlockManagerMasterEndpoint: Removing block manager BlockManagerId(6, 192.168.10.37, 57139) INFO BlockManagerMaster: Removed 6 successfully in removeExecutor INFO AppClient 2.<init>(UnsafeRowSerializer.scala:55)ERRORTaskSchedulerImpl:Lostexecutor6on192.168.10.37:remoteRpcclientdisassociatedINFOTaskSetManager:Re?queueingtasksfor6fromTaskSet6.0WARNReliableDeliverySupervisor:Associationwithremotesystem[akka.tcp://sparkExecutor@192.168.10.37:42250]hasfailed,addressisnowgatedfor[5000]ms.Reason:[Disassociated]WARNTaskSetManager:Losttask3.0instage6.0(TID102,192.168.10.37):ExecutorLostFailure(executor6lost)INFODAGScheduler:Executorlost:6(epoch8)INFOBlockManagerMasterEndpoint:Tryingtoremoveexecutor6fromBlockManagerMaster.INFOBlockManagerMasterEndpoint:RemovingblockmanagerBlockManagerId(6,192.168.10.37,57139)INFOBlockManagerMaster:Removed6successfullyinremoveExecutorINFOAppClientClientEndpoint: Executor updated: app-20160115142128-0001/6 is now EXITED (Command exited with code 52)
INFO SparkDeploySchedulerBackend: Executor app-20160115142128-0001/6 removed: Command exited with code 52
INFO SparkDeploySchedulerBackend: Asked to remove non-existent executor 6
org.apache.spark.SparkException: Job aborted due to stage failure: Task 0 in stage 6.0 failed 4 times, most recent failure: Lost task 0.3 in stage 6.0 (TID 142, 192.168.10.36): ExecutorLostFailure (executor 4 lost)
WARN TaskSetManager: Lost task 4.1 in stage 6.0 (TID 137, 192.168.10.38): java.lang.OutOfMemoryError: GC overhead limit exceeded
解决办法:
由于我们在执行Spark任务是,读取所需要的原数据,数据量太大,导致在Worker上面分配的任务执行数据时所需要的内存不够,直接导致内存溢出了,所以我们有必要增加Worker上面的内存来满足程序运行需要。 在Spark Streaming或者其他spark任务中,会遇到在Spark中常见的问题,典型如Executor Lost相关的问题(shuffle fetch失败,Task失败重试等)。这就意味着发生了内存不足或者数据倾斜的问题。这个目前需要考虑如下几个点以获得解决方案:

A.相同资源下,增加partition数可以减少内存问题。 原因如下:通过增加partition数,每个task要处理的数据少了,同一时间内,所有正在运行的task要处理的数量少了很多,所有Executor占用的内存也变小了。这可以缓解数据倾斜以及内存不足的压力。 B.关注shuffle read阶段的并行数。例如reduce, group 之类的函数,其实他们都有第二个参数,并行度(partition数),只是大家一般都不设置。不过出了问题再设置一下,也不错。 C.给一个Executor核数设置的太多,也就意味着同一时刻,在该Executor的内存压力会更大,GC也会更频繁。我一般会控制在3个左右。然后通过提高Executor数量来保持资源的总量不变。

  1. Spark Streaming 和kafka整合
    报错信息如下:

OffsetOutOfRangeException
解决方案:
如果和kafka消息中间件结合使用,请检查消息体是否大于默认设置1m,如果大于,则需要设置fetch.message.max.bytes=1m, 这里需要把值设置大些

17.报错信息:
java.io.IOException : Could not locate executable null\bin\winutils.exe in the Hadoop binaries.(spark sql on hive 任务引发HiveContext NullPointerException)

解决办法:
在开发hive和Spark整合的时候,如果是Windows系统,并且没有配置HADOOP_HOME的环境变量,那么可能找不到winutils.exe这个工具,由于使用hive时,对该命令有依赖,所以不要忽视该错误,否则将无法创建HiveContext,一直报Exception in thread “main” java.lang.RuntimeException: java.lang.NullPointerException 因此,解决该办法有两个方式

方案A:
把任务打包成jar,上传到服务器上面,服务器是配置过HADOOP_HOME环境变量的,并且不需要依赖winutils,所以只需要通过spark-submit方式提交即可,如:

spark-submit --class com.pride.hive.HiveOnSparkTest --master spark://bdata4:7077 spark-simple-1.0.jar
方案B:
解决winutils.exe命令不可用问题,配置Windows上面HADOOP_HOME的环境变量,或者在程序最开始的地方设置HADOOP_HOME的属性配置,这里需要注意,由于最新版本已经没有winutils这些exe命令了,我们需要在其他地方下载该命令放入HADOOP的bin目录下,当然也可以直接配置下载项目的环境变量,变量名一定要是HADOOP_HOME才行

下载地址: (记得FQ哦)
https://github.com/srccodes/hadoop-common-2.2.0-bin/archive/master.zip
任何项目都生效,需要配置Windows的环境变量,如果只在程序中生效可在程序中配置即可,如:

//用于解决Windows下找不到winutils.exe命令
System. setProperty(“hadoop.home.dir”, “E:\Software\hadoop-common-2.2.0-bin” );

19.报错信息:
Exception in thread “main” org.apache.hadoop.security.AccessControlException : Permission denied: user=Administrator, access=WRITE, inode=“/data”:bdata:supergroup:drwxr-xr-x

解决办法
1.在系统的环境变量或JVM变量里面添加HADOOP_USER_NAME,如程序中添加: System.setProperty(“HADOOP_USER_NAME”, “bdata”);, 这里的值就是以后会运行HADOOP上的Linux的用户名,如果是eclipse,则修改完重启eclipse,不然可能不生效 2.修改有问题的目录权限

hadoop fs -chmod 755 /tmp
并hive-site.xml文件中增加以下配置

hive.scratch.dir.permission 755

20.运行Spark-SQL报错:
org.apache.spark.sql.AnalysisException: unresolved operator 'Project
解决办法:
在Spark-sql和hive结合时或者单独Spark-sql,运行某些sql语句时,偶尔出现上面错误,那么我们可以检查一下sql的问题,这里遇到的问题是嵌套语句太多,导致spark无法解析,所以需要修改sql或者改用其他方式处理;特别注意该语句可能在hive里面没有错误,spark才会出现的一种错误。

21.报错信息如下:
org.apache.spark.SparkException: Only one SparkContext may be running in this JVM (see SPARK-2243). To ignore this error, set spark.driver.allowMultipleContexts = true.

解决方案:
使用Use this constructor JavaStreamingContext(sparkContext: JavaSparkContext, batchDuration: Duration) 替代 new JavaStreamingContext(sparkConf, Durations.seconds(5))

22.报错信息如下:
java.lang.IllegalArgumentException: requirement failed: No output operations registered, so nothing to execute
解决方案:
tranformation最后一步产生的那个RDD必须有相应Action操作,例如massages.print()等

23.报错信息如下:
ERROR ApplicationMaster: SparkContext did not initialize after waiting for 100000 ms. Please check earlier log output for errors. Failing the application

解决方案:
资源不能分配过大,或者没有把.setMaster(“local[*]”)去掉

24.报错信息如下:
java.util.regex.PatternSyntaxException: Dangling meta character ‘?’ near index 0
解决方案:
元字符记得转义

25.报错信息如下:
Exception in thread “main” java.lang.NoClassDefFoundError: org/apache/hadoop/fs/FSDataInputStream
解决方案:
编译spark用了hadoop-provided参数,导致缺少hadoop相关包

26.报错信息如下:
org.apache.spark.SparkException: Task failed while writing rows Caused by: org.elasticsearch.hadoop.rest.EsHadoopInvalidRequest: null

解决方案:
ES负载过高,修复ES

27.报错信息如下:
org.apache.spark.SparkException: Task failed while writing rows scala.MatchError: Buffer(10.113.80.29, None) (of class scala.collection.convert.Wrappers$JListWrapper)

解决方案:
ES数据在sparksql类型转化时不兼容,可通过EsSpark.esJsonRDD以字符串形式取ES数据,再把rdd转换成dataframe

28.报错信息如下:
SparkListenerBus has already stopped! Dropping event SparkListenerStageCompleted
解决方案:
集群资源不够,确保真实剩余内存大于spark job申请的内存

29.报错信息如下:
ExecutorLostFailure (executor 3 exited caused by one of the running tasks) Reason: Container killed by YARN for exceeding memory limits. 61.0 GB of 61 GB physical memory used

解决方案:
配置项spark.storage.memoryFraction默认值为0.6, 应加大spark.storage.memoryFraction的系数

30.问题如下:
如何定位spark的数据倾斜
解决方案:
在Spark Web UI看一下当前stage各个task分配的数据量以及执行时间,根据stage划分原理定位代码中shuffle类算子

31.报错信息如下:
如何解决spark数据倾斜
解决方案:
过滤少数导致倾斜的key(仅限于抛弃的Key对作业影响很小)
提高shuffle操作并行度(提升效果有限)
两阶段聚合(局部聚合+全局聚合),先对相同的key加前缀变成多个key,局部shuffle后再去掉前缀,再次进行全局shuffle(仅适用于聚合类的shuffle操作,效果明显,对于join类的shuffle操作无效),
将reduce join转为map join,将小表进行广播,对大表map操作,遍历小表数据(仅适用于大小表或RDD情况)
使用随机前缀和扩容RDD进行join,对其中一个RDD每条数据打上n以内的随机前缀,用flatMap算子对另一个RDD进行n倍扩容并扩容后的每条数据依次打上0~n的前缀,最后将两个改造key后的RDD进行join(能大幅缓解join类型数据倾斜,需要消耗巨额内存)

32.报错信息如下:
org.apache.spark.SparkException: Failed to get broadcast_790_piece0 of broadcast_790
解决方案:
删除spark-defaults.conf文件中spark.cleaner.ttl的配置

33.报错信息如下:
MapperParsingException[Malformed content, must start with an object
解决方案:
采用接口JavaEsSpark.saveJsonToEs,因为saveToEs只能处理对象不能处理字符串

34.报错信息如下:
java.util.concurrent.TimeoutException: Cannot receive any reply in 120 seconds
解决方案:
确保所有节点之间能够免密码登录
确保所在的主机满足spark-env.sh中分配的CPU个数,若spark-env.sh中分配的CPU个数为一个,而master和worker在同一部主机上,则该主机需最少分配2个CPU

35.报错信息如下:
Exception in thread “main” org.apache.spark.SparkException: Yarn application has already ended! It might have been killed or unable to launch application master.

解决方案:
出现此类问题有很多种, 当时遇到这问题的因为是在spark未改动的情况下, 更换了Hive的版本导致版本不对出现了此问题, 解决此问题的方法是:

再次运行spark计算, 查看日志中Hive的版本, 检查当前Hive是否与Spark日志中的Hive版本一致
若Hive版本不一致, 则删除现有的Hive, 并删除MySQL中Hive的元数据(若使用MySQL元数据库), HDFS上hive, tmp, user目录下的数据
安装与Spark日志中版本匹配的Hive

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加:2022-09-13 11:22:42  更:2022-09-13 11:23:37 
 
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