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[开发工具]关于Rdkit安装与解决Jupyter环境无法导入rdkit模块问题(纯新手经验)

1.安装Anaconda

? ? ?可以自行在Anaconda下载安装。

2.打开Anaconda prompt(开始菜单Anaconda文件夹里面)

? ? 执行下面这条代码安装Rdkit环境。

conda create -c rdkit -n my-rdkit-env rdkit

然后等待安装,安装成功的应该如下图:

?然后根据提示激活环境(active environment),执行激活代码。

conda activate my-rdkit-env

激活完成后截图如下:

到这就完成了rdkit的安装与激活,然后想要在jupyter notebook 运行还需要进行下面操作。

3. jupyter与rdkit环境搭建

?由于jupyter的初始环境为anaconda,安装rdkit环境无法从Jupyter打开,没有rdkit环境如下:

?首先,执行以下代码来切换base模式:

conda deactivate

在输入以下代码来进行安装?nb_conda:

conda install nb_conda

安装成功结果如下:

然后切换到my-rdkit-env环境。

conda activate my-rdkit-env

?最后一步就是安装 ipykernel,执行以下代码:

conda install -n my-rdkit-env ipykernel

安装完成后显示done表示安装完成(下图显示已经安装过ipykernel)。

?然后打开jupyter notebook 选择my-rdkit-env 环境下python即可。

打开之后可以检查以下是否能正常导入rdkit。

?接下来就可以在jupyter正常使用rdkit了

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加:2021-08-17 15:35:56  更:2021-08-17 15:37:56 
 
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