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[游戏开发]chipseq MACS2 call peaks 报错解决方法——创建虚拟环境 |
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错误描述: macs2 callpeak -c SRR620208.bam -t SRR620204.bam -q 0.05 -f BAM -g mm -n SRR620204VS8 bam文件已经跑好,下一步就要call peaks了,使用macs v2.2.7.1 出现错误: Traceback (most recent call last): 解决方法: 因担心对base环境的干扰,因此创建一个合适的虚拟环境,在该环境下完成macs2相关环境的配置: 经过查询版本需求,发现:macs v2.2.7.1 需要依赖python3.9版本,因此先创建一个python3.9的虚拟环境 conda create -n MACS python=3.9
conda activate MACS #激活所需环境 conda install -c anaconda numpy #安装numpy conda install -c bioconda macs2 #安装macs2 macs2 callpeak -c SRR620208.bam -t SRR620204.bam -q 0.05 -f BAM -g mm -n SRR620204VS8 #再次运行
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