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[网络协议]基于CUDA和TCP通信的大数据双机加速计算 |
1 环境/技术简介1.1 程序运行环境 1) server端计算机 操作系统:Ubuntu 18.04.5 LTS 运行环境:VSCode或Bash终端 2) client端计算机 操作系统:Ubuntu 16.04 LTS 运行环境:VSCode或Bash终端 1.2 硬件配置 1) server端计算机 CPU:Intel CoreTM i7-8700K CPU @ 3.70GHz×12 GPU:NVIDIA TITAN Xp COLLECTORS EDITION 2) client端计算机 CPU:Intel CoreTM i7-8700K CPU @ 3.70GHz×12 GPU:NVIDIA GeForce RTX 2080 Ti 1.3 技术简介 1) CUDA CUDA(Compute Unified Device Architecture),是显卡厂商NVIDIA推出的运算平台。 CUDA?是一种由NVIDIA推出的通用并行计算架构,该架构使GPU能够解决复杂的计算问题。它包含了CUDA指令集架构(ISA)以及GPU内部的并行计算引擎。开发人员可以使用C语言、C++等高级语言来为CUDA?架构编写程序,所编写出的程序可以在支持CUDA?的处理器上以超高性能运行。GPU包含了比CPU更多的处理单元,更大的带宽从而以多核并行的优势加速计算。 2) TCP 传输控制协议(TCP,Transmission Control Protocol)是一种面向连接的、可靠的、基于字节流的传输层通信协议,由IETF的RFC 793定义。TCP是因特网中的传输层协议,使用三次握手协议建立连接。当主动方发出SYN连接请求后,等待对方回答SYN+ACK,并最终对对方的 SYN 执行 ACK 确认。这种建立连接的方法可以防止产生错误的连接,TCP使用的流量控制协议是可变大小的滑动窗口协议。 2 基础模块描述2.1 宏定义说明 1) #define MAX_THREADS 单机CPU可真实调用的最大线程数,定义为64,在此程序中用于后续数据量的计算。 2) #define SUBDATANUM 单机CPU每个线程负责处理的数据量,在单机运行时定义为2000000,在双机加速运行时分别在两台计算机上定义为1000000,在此程序中用于后续数据量的计算。 3) #define DATANUM 单机负责处理的数据总量,其值定义为(SUBDATANUM * MAX_THREADS)。 4) #define BLOCKSIZE 用于传给双机加速程序中排序功能所调用的CUDA核函数,用于规定核函数声明的GPU的线程块(Block)数量。经测试,在DATANUM的数据量下,其被定义为4096,从而达到最高加速比。 2.2 基础功能设计 2.2.1 串行函数sumCommon() 以串行的方式使用for循环进行累加,累加的数值为每一位数据进行过log(sqrt())操作后的数值。当以float作为数据类型进行累加操作时,发现运算结果与理论值相差较远,因此改用double作为运算的数据类型,该函数也返回double型的累加结果。该求和算法的时间复杂度为O(n)。 2.2.2 串行函数maxCommon() 以串行的方式使用for循环进行逐位比较,进行比较的数值均为经过log(sqrt())操作后的数值。将逐次比较后取得的float型最大值作为返回值返回。该求最大值算法的时间复杂度为O(n)。 2.2.3 串行函数sortCommon() 采用归并排序算法进行排序,其时间复杂度为O(nlog2n),对于本题中的大量顺序排列的原始数据,常用的冒泡排序、快速排序等排序算法的时间复杂度均为O(n2),目前普通计算机所使用的CPU无法在有效时间内完成该排序任务,其加速比可认为是“无穷大”,故选择归并排序。归并排序(MERGE-SORT)是利用归并的思想实现的排序方法,该算法采用经典的分治(divide-and-conquer)策略(分治法将问题分(divide)成一些小的问题然后迭代求解,而治(conquer)的阶段则将分的阶段得到的各答案“修补”在一起,即分而治之)。归并排序的算法基本思想如下图所示: 图2.1 归并排序(MergeSort)基本思想 3 加速设计3.1 SpeedUp类 SpeedUp类封装有与CUDA加速相关的各种方法,包括类的构造和析构、数据初始化、CUDA初始化、打印CUDA信息、CUDA加速版求和函数、CUDA加速版求最大值函数、CUDA加速版归并排序函数和排序结果校验函数。 3.3.1 SpeedUp类构造与析构 在类的构造函数中,完成了对CUDA的初始化操作,在终端打印CUDA硬件的信息,并创建了CUDA消息处理器,申请了原始数据所需的CPU内存空间,还对其中的数据进行了初始化。在析构函数中,释放了创建对象时开辟的CPU内存空间,销毁了CUDA的消息处理器,并且重置了GPU,为之后程序的正常运行提供了保障。数据初始化的顺序为由小到大,即从1初始化至DATANUM;排序结果的校验则验证排序后的数据是否为倒序,即从DATANUM至1。SpeedUp类的构造与析构函数的编写降低了用户使用该类进行基础运算CUDA加速的门槛,用户仅需创建一个SpeedUp的对象,即可直接调用其中的加速函数。 1) 不可分页数据 在后续的CUDA加速操作中,需要将CPU内存中的数据拷贝至GPU内存中,此过程将带来较大的开销,因此考虑在存储原始数据时就进行优化。即将原始数据存储为不可分页数据,使其始终存在于物理内存中,不会被分配到低速的虚拟内存中。使用cudaMallocHost()函数开辟CPU内存空间即可实现该目的,其实质是强制让系统在物理内存中完成内存申请和释放的工作,不参与页交换,从而提高系统效率,其原理如图3.1所示。 图3.1不可分页数据加速原理 3.3.2 成员函数sumSpeedUp() 求和函数的加速思路整体基于并行归约算法,将数据分组进行层层并行运算,最后再统一归约。该函数内部使用CUDA进行加速的过程分为七步,程序流程图如图3.2所示。值得一提的是,在步骤一中配置核函数最优参数的方法是通过调用CUDA库中的cudaOccupancyMaxPotentialBlockSize()函数来计算最优的线程块数量和块中的线程数,在题设数据量下,其最优配置为:线程块数量=62500,块中线程数=1024。步骤六中为串行执行的for循环对由GPU上每个线程块返回的数据进行收割归约,因开辟线程开销占比较大,因而并未采取多线程并行。以下将对该函数中所采取的加速方法进行进一步的说明。 图3.2 sumSpeedUp()函数程序流程图 1) 并行归约 由于加法的交换律和结合律,数组可以以任意顺序求和。首先把输入数组划分为更小的数据块,之后用一个线程计算一个数据块的部分和,最后把所有部分和再求和得出最终结果。计算时首先将相邻的两数相加,结果写入第一个数的存储空间内。第二轮迭代时我们再将第一次的结果两两相加得出下一级结果,一直重复这个过程最后直到我们得到最终的结果,而其余单元里面存储的内容是我们不需要的。这个过程中每一轮迭代后,选取被加数的跨度将翻倍。该算法将时间复杂度由O(n)变为了O(log2n)。在每一层的CUDA加速运算中,又由多个线程分别负责一组数据的运算,因此实现了大量线程的并行运算,极大提升了速度。该并行求和算法原理图如图3.3所示。 图3.3并行归约(相邻)求和算法原理图 2) 交错配对归约 与前述的相邻并行归约不同,交错配对归约改变了选取数据的跨度,始终对位于前部的内存单元进行修改。该方法使前部的线程束最大程度地利用数据,将内存请求集中于该部分活跃的线程束,而后部的线程束虽同时工作但不请求内存,该方法使其最大效率地利用带宽。 图3.4并行归约(交错)求和算法原理图 3) 共享内存 核函数是CUDA加速计算的核心,承担了计算部分的主要功能,因此对内存的请求主要集中于核函数中。为减少对全局内存访问的开销,此处引入共享内存作为可编程管理缓存,让其缓存片上的数据,从而减少核函数中全局内存访问的次数。 3.3.3 成员函数maxSpeedUp() 求最大值函数的加速思路与前述求和函数大致相同,除运算方式不同外没有本质上的变化,其整体基于并行归约算法。其程序流程图如图3.2所示。在题设数据量下,其核函数最优配置为:线程块数量=62500,块中线程数=1024。其采取的加速方法与求和函数中的一致,可参考上一小节的内容。 3.3.4 成员函数sortSpeedUp() 排序函数的加速思路与前述两个函数有所不同,由于其不仅设计存储单元数据之间的运算,还涉及到其存储位置的调配,因此考虑其他加速思路。其程序流程图仍如图3.2所示。在步骤一中配置核函数的基础参数,其线程块数量由宏定义的BLOCKSIZE确定,而每个线程块中仅包含一个线程,因此将其核函数配置为:线程块数量=4096,块中线程数=1。在单机未加速程序中已经使用归并排序算法将其运算时间压缩到了较低水平,因此CUDA加速方面较难从算法本身对其进行进一步的加速,在该部分实现中的加速策略如图3.5所示,以下对其采取的加速方法进行进一步的说明。 图3.5排序功能加速策略架构图 1) CUDA多线程并行 使用GPU中的4096*1个线程对归并排序迭代过程中的每一组数据分别排序,每个线程分别负责DATANUM/BLOCKSIZE个数据的排序运算,达到4096个线程的并行排序,从而提升归并排序的运算速度。此加速方法为CUDA最基础的加速方法,前述函数也在使用。 2) CPU多线程收割 当CUDA完成4096组数据分别的组内排序之后,需要将数据重新拷贝回CPU内存中,此时对4096组数据进行统一的归并排序仍然具有巨大的计算量。因此此时在CPU上开辟4个线程同时对4096组数据进行收割,每个线程负责收割1024组数据。此轮收割完成后再对4组有序的数据进行一轮收割,即可完成此台计算机负责的所有数据的排序工作。 3) 运算与TCP接收双线程同步 由于需要进行双机协同运算,双机由于硬件型号和性能的个体差异,可能不能同时完成各自数据的运算。在双机协同大数据运算的实现中发现,局域网内双机TCP通信传输大量数据需要极大的时间开销,因此将接收数据与本机运算并行起来成为加速的考虑重点之一。作为server的计算机运算速度相对client计算机较慢,若需要server计算机完成本机运算后才能监听TCP消息并接收数据将造成较大的时间开销。因此在server端的主函数中开辟双线程,线程1负责进行本机数据的排序运算,线程2负责监听TCP信道并接收client发送来的有序数据。 4 通信设计4.1 tcp_send类 1)类内属性:类内属性包括公有属性和私有属性。其中,公有属性有TCP通信的socket号,私有属性有通信地址和通信初始化时的发送接收缓存区。类属性具体命名如下: int socket_fd;???????? //socket号 struct sockaddr_in addr;?????????????? //通信地址 ??? char buffer[255];?????????? //接收缓存区 ??? double hot;?????????????????? //发送缓存区 2)类内函数:类内函数包括构造函数、析构函数、发送初始化化函数、客户端初始化函数、发送浮点型数组函数、发送单个浮点数函数和发送单个双精度数函数。其中,发送初始化函数完成与另一台计算机的通信连接,构造函数调用了发送初始化函数,完成发送端的初始化工作,析构函数执行关闭TCP通信端口的操作。类函数具体如下: ??? tcp_send()??????????????????? //构造函数 ??? { ??????? send_initial();?????????????? //调用类内发送初始化函数 } ??? ~tcp_send()????????????????? //析构函数 ??? { ??????? close(fd);????????????????????? //关闭TCP通信端口 } void send_initial();??????? //发送初始化函数 void client_ready();?????? //客户端初始化函数 void send(float *data,const int &datanum);????????? //发送浮点型数组函数 void send(const float &data);???????????????????????????? //发送单个浮点数函数 void send(const double &data);????????????????????????? //发送单个双精度数函数 4.2 tcp_receive类 1)类内属性:类内属性包括公有属性和私有属性。其中,公有属性有TCP通信的socket号和通信初始化时的发送接收缓存区,私有属性有通信地址。类属性具体命名如下: int fd;??????????????????? //client端的socket号 int socket_fd;???????? //server端的socket号 ??? char buffer[255];?????????? //接收缓存区 double hot;?????????????????? //发送缓存区 struct sockaddr_in addr;?????????????? //通信地址 2)类内函数:类内函数包括构造函数、析构函数、接收初始化函数、服务端初始化函数、接收浮点型数组函数、接收单个浮点数函数和接收单个双精度数函数。其中,接收初始化函数完成与另一台计算机的通信连接,构造函数调用了接收初始化函数,完成接收端的初始化工作,析构函数执行关闭TCP通信端口的操作。类函数具体如下: ??? tcp_receive()???????????????? //构造函数 ??? { ??????? receive_initial();?????????????????? //调用类内接收初始化函数 ??? } ??? ~tcp_receive()?????????????? //析构函数 ??? { ??????? close(socket_fd);????????????????? //关闭TCP通信端口 } void receive_initial();?????????? //接收初始化函数 void server_ready();???????????? //服务端初始化函数 void receive(float *data,const int &datanum);???????????? //接收浮点型数组函数 void receive(float &data);??????????????????????????????????????? //接收单个浮点数函数 void receive(double &data);???????????????????????????????????? //接收单个双精度数函数 5 性能测试5.1演示/测试环境的搭建 1)分别在服务端和客户端的计算上安装cuda,在本次实验中,服务端计算机安装的cuda版本为cuda 11.5,客户端计算机安装的cuda版本为cuda 11.0。 2)将两台计算机用网线连接,并设置为局域网通信模式。服务端在网络设置中将IPv4设置为手动模式,并将其地址设置为192.168.1.106,子网掩码设置为255.255.255.0,网关设置为192.168.1.10。客户端在网络设置中将IPv4设置为手动模式,并将其地址设置为192.168.1.112,子网掩码设置为255.255.255.0,网关设置为192.168.1.10。 5.2操作步骤 1)分别在两台计算机上的单机文件夹SingComputer下打开终端,为了防止栈溢出,首先通过运行ulimit –s 1048576指令来开辟足够的栈空间,接着通过g++ main.cpp –o main指令编译main.cpp文件,编译完成后在终端中通过./main指令运行单机程序5次,记下每一次单机计算所需的时间。 2)在服务端的DistributedComputing_Server文件夹下打开终端,为了防止栈溢出,首先通过运行ulimit –s 1048576指令来开辟足够的栈空间,接着通过nvcc –lcublas main.cu –o main指令编译main.cu文件,编译完成后在终端通过./main指令运行服务端程序,等待客户端的连接。 3)在客户端的DistributedComputing_Client文件夹下打开终端,为了防止栈溢出,首先通过运行ulimit –s 1048576指令来开辟足够的栈空间,接着通过nvcc –lcublas main.cu –o main指令编译main.cu文件,编译完成后在终端通过./main指令运行客户端程序。至此服务端和客户端连接上开始计算数据。 4)按步骤2和步骤3运行五次,记录每一次并行计算所需的时间。 5.3 测试结果及评价 按照上述步骤运行程序。单机运行时,第一台计算机在终端运行时的结果如图5.1所示,第二台计算机在终端运行时的结果如图5.2所示。多机运行时,服务端的运行结果如图5.3所示。 ?图5.1单机运行时第一台计算机的运行结果 ?图5.2单机运行时第二台计算机的运行结果 ?图5.3多机运行时服务端的运行结果 单机运行时,服务端的计算耗时见表1,客户端的计算耗时见表2。两台计算机并发执行时,计算耗时见表3。单机运行与并行计算的耗时对比见表4。由实验结果可见,对于求和与求最大值,使用两台电脑并行计算并且采用cuda加速的方式,其计算速度相比单机单线程大大提高,加速比为几十倍。对于排序算法,在64*2000000的数据量下,若采用冒泡排序等简单的排序算法,单机运行的时间很长,无法在有限的时间内完成排序,其加速比固然很大,本实验单机和并行计算都采用了归并排序算法,归并排序本身具有加速排序的效果,使用两台电脑并行计算并且采用cuda加速的方式,相比单机单线程的计算方式,其加速比约为5倍。总体加速效果较好。 表1、服务端单机运行耗时表
表2、客户端单机运行耗时表
表3、并行计算耗时表
表4、单机运行与并行计算耗时对比表
6?程序使用说明(1)单机运行程序在SingleComputer文件夹下,采用g++ main.cpp –o main指令编译生成可执行文件main。 (2)多机运行,服务端程序在DistributedComputing_Server文件夹下,客户端程序在DistributedComputing_Client文件夹下。多机运行时,首先需要将服务端代码中的tcp.h文件中(第124行)的receive_initial()函数的addr.sin_addr.s_addr = inet_addr("192.168.1.106")代码中的IP地址改为本机的IP地址,还需将客户端代码中的tcp.h文件中(第84行)的send_initial()函数中的addr.sin_addr.s_addr = inet_addr("192.168.1.106")代码中的IP地址改为服务端的IP地址,并且需要保证服务端和客户端的端口号一致。 (3)多机运行时服务端和客户端的程序使用nvcc –lcublas main.cu –o main指令进行编译,使用./main执行。 (4)为了防止栈溢出,在运行程序前可执行ulimit –s 1048576指令来开辟足够的栈空间。 7 参考文献[1] C++八大排序算法, https://blog.csdn.net/qq_33596574/article/details/88827925 [2] Linux vscode 开大栈空间, https://www.cnblogs.com/GK0328/p/13673855.html [3] CUDA C++ Programming Guide, https://docs.nvidia.com/cuda/cuda-c-programming-guide/index.html [4] CUDA C++ Best Practices Guide, https://docs.nvidia.com/cuda/cuda-c-best-practices-guide/index.html [5] CUDA编程第三章: CUDA执行模型, https://blog.csdn.net/qq_42683011/article/details/113593860?spm=1001.2014.3001.5501 [6] CUDA编程第五章: 共享内存&常量内存, https://blog.csdn.net/qq_42683011/article/details/113820683?spm=1001.2014.3001.5501 该项目具体代码可参考github:https://github.com/TJHDL/Dual-Computer-Acceleration-with-CUDA-and-TCP |
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