IT数码 购物 网址 头条 软件 日历 阅读 图书馆
TxT小说阅读器
↓语音阅读,小说下载,古典文学↓
图片批量下载器
↓批量下载图片,美女图库↓
图片自动播放器
↓图片自动播放器↓
一键清除垃圾
↓轻轻一点,清除系统垃圾↓
开发: C++知识库 Java知识库 JavaScript Python PHP知识库 人工智能 区块链 大数据 移动开发 嵌入式 开发工具 数据结构与算法 开发测试 游戏开发 网络协议 系统运维
教程: HTML教程 CSS教程 JavaScript教程 Go语言教程 JQuery教程 VUE教程 VUE3教程 Bootstrap教程 SQL数据库教程 C语言教程 C++教程 Java教程 Python教程 Python3教程 C#教程
数码: 电脑 笔记本 显卡 显示器 固态硬盘 硬盘 耳机 手机 iphone vivo oppo 小米 华为 单反 装机 图拉丁
 
   -> 系统运维 -> HiCExplorer使用笔记 -> 正文阅读

[系统运维]HiCExplorer使用笔记

刚刚考上研究生的生信小白,终于在各种查资料然后尝试下成功在Ubuntu上下载HiCExplorer!要自己记录一下,呜呜呜!

下载流程:

1.首先需要下载Ubuntu,在Ubuntu中下载miniconda

wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-4.3.21-Linux-x86_64.sh

2.bash安装miniconda

bash Miniconda-latest-Linux-x86_64.sh

3.根据提示安装,之后再

source ~/.bashrc

4.之后添加所需要的channels(之前下载的时候安装了一些清华源等等,在下载HicExplorer时这些源中都不包含,只在Bioconda中含有)

  conda config --add channels r
 conda config --add channels bioconda

5.查看channels

conda config --get channels

6.安装HiCExplorer

conda create -n hicexplorer python=3.7
conda activate hicexplorer
conda install hicexplorer

?Bioconda只能在Linux系统或者虚拟机例如Ubuntu你中安装成功,一开始在windows下的anconda下总是出现错误,会报错。之后使用Ubuntu后开始还是报错,后来使用下面这条命令

conda config --set channel_priority flexible

还有更新了conda之后就可以使用啦!!

之后的使用直接conda activate hicexplorer就可以运行啦!

之后继续跟着https://hicexplorer.readthedocs.io/en/latest/index.html学习。

感谢之前看到的各种问题我解决的帖子。。。

  系统运维 最新文章
配置小型公司网络WLAN基本业务(AC通过三层
如何在交付运维过程中建立风险底线意识,提
快速传输大文件,怎么通过网络传大文件给对
从游戏服务端角度分析移动同步(状态同步)
MySQL使用MyCat实现分库分表
如何用DWDM射频光纤技术实现200公里外的站点
国内顺畅下载k8s.gcr.io的镜像
自动化测试appium
ctfshow ssrf
Linux操作系统学习之实用指令(Centos7/8均
上一篇文章      下一篇文章      查看所有文章
加:2021-07-25 16:17:28  更:2021-07-25 16:17:47 
 
开发: C++知识库 Java知识库 JavaScript Python PHP知识库 人工智能 区块链 大数据 移动开发 嵌入式 开发工具 数据结构与算法 开发测试 游戏开发 网络协议 系统运维
教程: HTML教程 CSS教程 JavaScript教程 Go语言教程 JQuery教程 VUE教程 VUE3教程 Bootstrap教程 SQL数据库教程 C语言教程 C++教程 Java教程 Python教程 Python3教程 C#教程
数码: 电脑 笔记本 显卡 显示器 固态硬盘 硬盘 耳机 手机 iphone vivo oppo 小米 华为 单反 装机 图拉丁

360图书馆 购物 三丰科技 阅读网 日历 万年历 2024年5日历 -2024/5/6 16:50:05-

图片自动播放器
↓图片自动播放器↓
TxT小说阅读器
↓语音阅读,小说下载,古典文学↓
一键清除垃圾
↓轻轻一点,清除系统垃圾↓
图片批量下载器
↓批量下载图片,美女图库↓
  网站联系: qq:121756557 email:121756557@qq.com  IT数码