conda的安装
使用wget命令下载anaconda或miniconda,推荐下载miniconda
wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
给执行权限并运行
chmod 777 Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
禁止环境变量
Do you wish the installer to initialize Miniconda3
by running conda init? [yes|no]
[no] >>>
切换到miniconda3/bin, 启动 conda
chmod 777 activate
source ./activate
添加清华源
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
显示已安装的频道
conda config --set show_channel_urls yes
查看已安装的频道
vim ~/.condarc
conda的使用
conda下载软件包
conda install xxx
搜索软件包
conda search xxx
查看该软件安装的位置
which xxx
安装特定版本的软件包
conda install 软件名=版本号
conda install pytorch=1.7.1
查看已安装软件
conda list
更新指定软件
conda update xxx
卸载指定软件
conda remove gatk
退出conda环境
../deactivate
conda deactivate
conda环境创建
conda create -n xxx python=x.x
删除环境
conda remove -n xxx --all
重命名环境
conda create -n 新名字 --clone 旧名字
conda remove -n 旧名字 --all
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