[系统运维]如何在Ubuntu上安装R以及Rstudio

1.安装R

最开始，我是使用Conda安装的r-base。

conda install r-base

Proceed ([y]/n)? 选择y即可。等待安装完毕。

终端输入 R 即可进入R。

遇到问题，/home/linan/yes/lib/R/bin/exec/R: error while loading shared libraries: libgomp.so.1: cannot open shared object file: No such file or directory

安装libgomp1即可。需要在root下操作。

sudo apt install -y libgomp1

Crtl+D? ##退出root

这下输入R就可以进入R啦。

退出R输入q()即可。

2.安装R-studio

官方下载https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/#download（根据自己版本自行选择）

下载完毕放置home/linan目录下。

输入sudo dpkg -i rstudio-2022.02.3-492-amd64.deb安装

遇到问题 如下dpkg: dependency problems prevent configuration of rstudio:rstudio depends on libssl-dev; however:

? ? ? ? ? ? ? ?Package libssl-dev is not installed.rstudio depends on libclang-dev; however:Package libclang-dev is not installed.

? ? ? ? ? ? ? ? rstudio depends on libxkbcommon-x11-0; however:Package libxkbcommon-x11-0 is not installed.

? ? ? ? ? ? ? ? rstudio depends on libpq5; however:Package libpq5 is not installed.

如何解决呢？一行代码解决。sudo apt --fix-broken install或者sudo apt-get install -f?

当然，有些同学安装报错，那么我们需要到root下操作。

sudo apt-get update? ###更新库

sudo apt --fix-broken install? ###缺啥补啥

sudo dpkg -i rstudio-2022.02.3-492-amd64.deb? ?###这次安装就不会报错啦

3.打开Rstudio

在终端输入rstudio即可进入。

又报错了，rstudio:error while loading shared libraries: libXcursor.so.1: cannot open shared object file: No such file or directory

怎么办呢？

使用sudo apt-get install libxcursor1安装即可

再次输入rstudio，再次报错！！！！rstudio: error while loading shared libraries: libXdamage.so.1: cannot open shared object file: No such file or directory

又怎么办呢？

此处推荐一个网站Ubuntu Repositories - pkgs.org

在该网站找到你需要的deb格式的对应文件，此处我们是libxdamage1_1.1.5-2_amd64.deb

找到它下载网址http://archive.ubuntu.com/ubuntu/pool/main/libx/libxdamage/libxdamage1_1.1.5-2_amd64.deb

使用wget下载，wget http://archive.ubuntu.com/ubuntu/pool/main/libx/libxdamage/libxdamage1_1.1.5-2_amd64.deb

下载完毕，需要放在home/linan目录下（默认就是该目录）。

安装，sudo dpkg -i libxdamage1_1.1.5-2_amd64.deb。

此时，再次输入rstudio,OK啦！！

4.在rstudio中安装R包

发现怎么安都安不上limma,Biocmanager等等任何包。

怎么回事呢？没有C++环境。

sudo apt-get install build-essential即可。

此时，可以安装包啦。

5.设置rstudio桌面快捷方式

自行找到rstudio.desktop，记住，不在主目录下！！

将它复制到桌面，右击，设置为可运行。

此处，遇到问题，双击打不开rstudio，因为找不到R的路径以及Module。

如何解决呢？我查看好多教程，没有合适解决方法（太菜了)，最终使用conda卸载r-base，从R官方网站下载最新版本R。官网有教程。

然后，桌面快捷方式就可以设置啦！！